R语言 sagenhaft包 sage.test()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

sage.test(sagenhaft)
sage.test()所属R语言包：sagenhaft

                                        Compare Two SAGE Libraries
                                         比较两个SAGE文库

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Compute p-values for differential expression for each tag between two SAGE libraries.
p值计算每个标签间的SAGE库的差异表达。


用法----------Usage----------


sage.test(x, y, n1=sum(x), n2=sum(y))



参数----------Arguments----------

参数：x
integer vector giving counts in first library. Non-integer values are rounded to the nearest integer.
整数向量中的第一个库的罪名。非整数值四舍五入到最接近的整数。


参数：y
integer vector giving counts in second library. Non-integer values are rounded to the nearest integer.
整数向量，在第二个库的罪名。非整数值四舍五入到最接近的整数。


参数：n1
total number of tags in first library. Non-integer values are rounded to the nearest integer.
标签中的第一个库的总数。非整数值四舍五入到最接近的整数。


参数：n2
total number of tags in second library. Non-integer values are rounded to the nearest integer.
第二个库的总数，标签。非整数值四舍五入到最接近的整数。


Details

详情----------Details----------

This function uses a binomial approximation to the Fisher Exact test for each tag. The approximation is accurate when n1 and n2 are large and x and y are small in comparison.
此功能使用二项式近似Fisher精确检验每一个标签。近似是准确的，当n1和n2大x和y是在比较小。


值----------Value----------

Numeric vector of p-values.
数字矢量p值。


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth



参见----------See Also----------

fisher.test
fisher.test


举例----------Examples----------


library(sagenhaft)
sage.test(c(0,5,10),c(0,30,50),n1=10000,n2=15000)
#  Exact equivalents[确切现金等价物]
fisher.test(matrix(c(0,0,10000-0,15000-0),2,2))$p.value
fisher.test(matrix(c(5,30,10000-5,15000-30),2,2))$p.value
fisher.test(matrix(c(10,50,10000-10,15000-50),2,2))$p.value

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。