R语言 Rtreemix包 distribution-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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distribution-methods(Rtreemix)
distribution-methods()所属R语言包：Rtreemix

                                        Method for generating the (scaled) probablility distribution
                                         （规模）probablility的分布产生方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions generate the probability distribution induced with a given mutagenetic trees mixture model model on the space of all possible patterns of genetic events. The model has to be specified. The sampling mode and the parameters for the sampling times of the observed input and output probabilities are optional. The number of genetic events in the model cannot exceed 30.
这些功能产生的概率分布与一个给定的致突变树木混合模型诱导model空间上的遗传事件的所有可能的模式。 model指定。观测到的输入和输出概率的采样时间，采样模式和参数都是可选的。的在model遗传事件的数量不能超过30个。


用法----------Usage----------


distribution(model, sampling.mode, sampling.param, output.param)



参数----------Arguments----------

参数：model
An RtreemixModel object that encodes a probability distribution on the set of all possible patterns.
RtreemixModel对象的编码上所有可能的模式集的概率分布。


参数：sampling.mode
A character that specifies the sampling mode ("constant" or "exponential") for the observed input and output probabilities.
一个character指定采样模式（“不变”或“指数”）为观测到的输入和输出的概率。


参数：sampling.param
A numeric that specifies the sampling parameter for the observed input probabilities corresponding to the sampling mode given by sampling.mode.
一个numeric指定为可观察的输入采样模式sampling.mode给予相应的概率抽样参数。


参数：output.param
A numeric that specifies the sampling parameter for the observed output probabilities corresponding to the sampling mode given by sampling.mode.     
一个numeric，指定相应的采样模式sampling.mode观察输出概率抽样参数。


值----------Value----------

The function returns a dataframe of all possible patterns with their corresponding probabilities derived from the specified trees mixture model. When the sampling mode and the sampling parameters (input and output) are specified their values are printed out.
该函数返回的所有可能的模式从指定的树木混合模型得出其相应的概率dataframe。当采样模式和采样参数（输入和输出）指定的值打印出来。


作者（S）----------Author(s)----------


Jasmina Bogojeska



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

RtreemixModel-class, fit-methods
RtreemixModel-class，fit-methods


举例----------Examples----------


## Generate a random RtreemixModel object with 3 components.[＃生成一个3元件的随机RtreemixModel对象。]
mod <- generate(K = 3, no.events = 8, noise.tree = TRUE, prob = c(0.2, 0.8))
show(mod)

## See the probability distribution encoded by the model on the set of all possible patterns.[＃见的概率分布模型上所有可能的模式集编码。]
distr <- distribution(model = mod)
distr

## Get the probabilities.[＃获取的概率。]
distr$probability

## See the probability distribution encoded by the model on the set of all possible patterns[＃见编码上所有可能的模式集的概率分布模型。]
## calculated for given sampling mode, and corresponding input and output parameters.[＃计算给定的采样模式，以及相应的输入和输出参数。]
distr1 <- distribution(model = mod, sampling.mode = "exponential", sampling.param = 1, output.param = 1)
distr1

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