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R语言 rtracklayer包 Quickload-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:39:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
Quickload-class(rtracklayer)
Quickload-class()所属R语言包:rtracklayer

                                        Quickload Access
                                         quickload访问

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The Quickload class represents a Quickload data source, essentially directory layout separating tracks and sequences by genome, along with a few metadata files. This interface abstracts those details and provides access to a Quickload at any URL supported by R (HTTP, FTP, and local files). This is an easy way to make data accessible to the Integrated Genome Browser (IGB).
类Quickload代表Quickload数据源,基本上目录布局随着几元数据文件,分离轨道和基因组序列。此接口抽象这些细节,并提供由R(HTTP,FTP和本地文件)支持的任何URL访问到Quickload。这是一个简单的方法,使数据访问的综合基因组浏览器(IGB)。


构造----------Constructor----------

Quickload(uri = "quickload", create = FALSE): Constructs a new Quickload object, representing a repository at uri. If create is TRUE, and uri is writeable (i.e., local), the repository is created if it does not already exist. If it does exist, then a message is emitted to indicate that the repository was not recreated.
Quickload(uri = "quickload", create = FALSE):构造一个新的Quickload对象,代表在uri库。 create如果是TRUE,uri是可写(即本地),库被创建,如果它已经不存在。如果它确实存在,那么发出消息表明仓库重建。


存取方法----------Accessor Methods----------

In the code snippets below, x represents a Quickload object.
在下面的代码片段,xQuickload对象。




x$genome, x[["genome"]]: Get the QuickloadGenome object for the genome named genome. This is where all the data is stored.
x$genome,x[["genome"]]:获取基因组名为QuickloadGenomegenome对象。这是所有的数据存储。




length(x): number of genomes in the repository
length(x):库中的基因组




uri(x): Get the URI pointing to the Quickload repository.
uri(x):获取URI指向的Quickload库。




genome(x): Get the identifiers of the genomes present in the repository.
genome(x):获取基因组标识符库中的呈现。


作者(S)----------Author(s)----------


Michael Lawrence



举例----------Examples----------


ql <- Quickload(system.file("tests", "quickload", package = "rtracklayer"))
uri(ql)
genome(ql)
ql$T_species_Oct_2011

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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