R语言 rtracklayer包 liftOver()函数中文帮助文档(中英文对照)

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liftOver(rtracklayer)
liftOver()所属R语言包：rtracklayer

                                         Lift intervals between genome builds
                                         电梯基因构建之间的间隔

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A reimplementation of the UCSC liftover tool for lifting features from one genome build to another. In our preliminary tests, it is significantly faster than the command line tool. Like the UCSC tool, a chain file is required input.
一个重新实现的提升从一个基因构建到另一个功能UCSC liftover工具。在我们的初步测试中，它是速度显着高于命令行工具。 UCSC的工具一样，连锁文件是必需的输入。


用法----------Usage----------


liftOver(x, chain, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
The intervals to lift-over, usually a GRanges.  
间隔解除，通常是GRanges。


参数：chain
A Chain object, usually imported with import.chain.   
一个的Chain对象，通常用import.chain进口。


参数：...
Arguments for methods.  
赞成对方法。


值----------Value----------

A GRanges object, with intervals mapped through the chain.
一个GRanges对象，通过连锁映射的间隔。


作者（S）----------Author(s)----------



Michael Lawrence




参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
chain <- import.chain("hg19ToHg18.over.chain")
library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)
tx_hg19 <- transcripts(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)
tx_hg18 <- liftOver(tx_hg19, chain)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。