R语言 rtracklayer包 browseGenome()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

browseGenome(rtracklayer)
browseGenome()所属R语言包：rtracklayer

                                         Browse a genome
                                         浏览基因组

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A generic function for launching a genome browser.
为开展基因组浏览器的一个泛型函数。


用法----------Usage----------


browseGenome(object, ...)
## S4 method for signature 'RangedDataORRangedDataList'
browseGenome(object,
  browser = "UCSC", range = base::range(object),
  view = TRUE, trackParams = list(), viewParams = list(),
  name = "customTrack", ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
A list of RangedData instances,  e.g. a RangedDataList instance.
RangedData实例，如列表RangedDataList实例。


参数：browser
The name of the genome browser.  
的基因组浏览器的名称。


参数：range
A genome identifier or a GRanges or RangesList to display in the initial view.  
A基因组标识符或GRanges或RangesList在初始视图显示。


参数：view
Whether to open a view.  
是否打开一看。


参数：trackParams
Named list of parameters to pass to track<-.  
命名参数列表传递到track<-。


参数：viewParams
Named list of parameters to pass to browserView.  
命名参数列表传递到browserView。


参数：name
The name for the track. Ignored if object is a RangedDataList, in which case the names are taken from the list names.  
曲目名称。被忽略，如果objectRangedDataList，在这种情况下，名称从列表名称。


参数：...
Arguments passed to browserSession.   
参数传递到browserSession。


值----------Value----------

Returns a BrowserSession.
返回BrowserSession。


作者（S）----------Author(s)----------


Michael Lawrence



参见----------See Also----------

BrowserSession and BrowserView, the two main classes for interfacing
BrowserSession和BrowserView，两个主要的接口类


举例----------Examples----------


  ## Not run: [＃无法运行：]
  ## open UCSC genome browser:[＃打开UCSC基因组浏览器：]
  browseGenome()
  ## to view a specific range:[＃查看一个特定的范围：]
  range <- GRangesForUCSCGenome("hg18", "chr22", IRanges(20000, 50000))
  browseGenome(range = range)
  ## a slightly larger range:[＃一个稍微更大的范围：]
  browseGenome(range = range, end = 75000)
  ## with a track:[轨道：]
  track <- import(system.file("tests", "v1.gff", package = "rtracklayer"))
  browseGenome(RangedDataList(track))
  
## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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