R语言 RTools4TB包 heatmapFromCDT()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

heatmapFromCDT(RTools4TB)
heatmapFromCDT()所属R语言包：RTools4TB

                                        Reads a "cdt" file containing a set of transcriptional signatures and produces heatmaps.
                                         读“CDT”文件，其中包含了一套转录签名，并产生热图。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function can be called to display the results of the createSignatures4TB function.
此功能可以叫显示的createSignatures4TB功能的结果。


用法----------Usage----------


heatmapFromCDT(cdt.filename, signature = NULL, fac = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：cdt.filename
a character string representing the "cdt" file name.
代表“CDT”文件名字符串。


参数：signature
a vector. By default (signature = NULL), all signatures are displayed.
一个向量。默认情况下（signature = NULL），所有签名都显示。


参数：fac
a factor. By default fac = NULL, no phenodata are displayed. If fac corresponds to a factor, the several levels of fac are displayed by a distinct color.
一个因素。默认情况下，fac = NULL，没有phenodata显示。如果因子对应的一个因素，几个因素的水平，显示不同的颜色。


作者（S）----------Author(s)----------


Bergon A., Lopez F., Textoris J., Granjeaud S. and Puthier D.



参考文献----------References----------

flexible toolbox to explore productively the transcriptional landscape of the Gene Expression Omnibus database. PLoSONE, 2008;3(12):e4001.

参见----------See Also----------

createSignatures4TB, plotGeneExpProfiles
createSignatures4TB，plotGeneExpProfiles


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
library(ALL)
data(ALL)
res <- createSignatures4TB(data=ALL, name="ALLdataset", median.center=TRUE, distance.method="pearson")
all <- heatmapFromCDT("ALLdataset.dataMods.cdt")
sig6 <- heatmapFromCDT("ALLdataset.dataMods.cdt", signature=6)
rownames(sig6)


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。