R语言 Rsamtools包 RsamtoolsFile()函数中文帮助文档(中英文对照)

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RsamtoolsFile(Rsamtools)
RsamtoolsFile()所属R语言包：Rsamtools

                                        A base class for managing file references in Rsamtools
                                         一个基类管理文件Rsamtools引用

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

RsamtoolsFile is a base class for managing file references in Rsamtools; it is not intended for direct use by users – see, e.g., BamFile.
RsamtoolsFile是一个管理文件中Rsamtools引用的基类，它的目的不是由用户直接使用 - 例如，见BamFile。


用法----------Usage----------



## accessors
index(object)
## S4 method for signature 'RsamtoolsFile'
path(object, ...)
## S4 method for signature 'RsamtoolsFile'
isOpen(con, rw="")
## S4 method for signature 'RsamtoolsFile'
show(object)




参数----------Arguments----------

参数：con, object
An instance of a class derived from RsamtoolsFile.
从RsamtoolsFile派生的类的一个实例。


参数：rw
Mode of file; ignored.
文件模式;忽略。


参数：...
Additional arguments, unused.
额外的参数，未使用。


类的对象----------Objects from the Class----------

Users do not directly create instances of this class; see, e.g., BamFile-class.
用户不直接创建这个类的实例，参见，例如，BamFile-class。


领域----------Fields----------

The RsamtoolsFile class is implemented as an S4 reference class. It has the following fields:
RsamtoolsFile类实施S4引用类的。它具有以下领域：




.extptr An externalptr initialized to an internal
externalptr。extptr初始化到内部




path A character(1) vector of the file name.
路径字符（1）向量的文件名。




index A character(1) vector of the index file name.
指数字符（1）向量的索引文件名。


函数和方法----------Functions and methods----------

Accessors:
存取：




path Returns a character(1) vector of BAM path names.
路径返回一个字符的BAM路径名（1）向量。




index Returns a character(1) vector of BAM index path
索引返回字符的BAM的索引路径（1）向量

Methods:
方法：




isOpen Report whether the file is currently open.
ISOPEN报告文件是否正在打开。




show Compactly display the object.
显示紧显示对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Morgan

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