R语言 Rsamtools包 Compression()函数中文帮助文档(中英文对照)

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Compression(Rsamtools)
Compression()所属R语言包：Rsamtools

                                         File compression for tabix (bgzip) and fasta (razip) files.
                                         TABIX（bgzip）和FASTA（razip）文件的文件压缩。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions compress files for use in other parts of Rsamtools: bgzip for tabix files, razip for random-access fasta files.
这些功能在Rsamtools的其他部分使用的文件压缩：bgzipTABIX文件，razip随机存取FASTA文件。


用法----------Usage----------



bgzip(file, dest=sprintf("%s.gz", file), overwrite = FALSE)
razip(file, dest=sprintf("%s.rz", file), overwrite = FALSE)




参数----------Arguments----------

参数：file
A character(1) path to an existing file. This file will be compressed.
一个字符（1）现有文件的路径。该文件将被压缩。


参数：dest
A character(1) path to a file. This will be the compressed file. If dest exists, then it is only over-written when overwrite=TRUE.
（1）字符文件的路径。这将是压缩文件。如果dest存在，那么它只能通过编写时overwrite=TRUE。


参数：overwrite
A logical(1) indicating whether dest should be over-written, if it already exists.
逻辑（1）是否dest应超额写的，如果它已经存在。


值----------Value----------

The full path to dest.
dest的完整路径。


作者（S）----------Author(s)----------



Martin Morgan <mtmorgan@fhcrc.org>




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

TabixFile, FaFile.
TabixFile，FaFile。


举例----------Examples----------



from <- system.file("extdata", "ex1.sam", package="Rsamtools")
to <- tempfile()
zipped <- bgzip(from, to)


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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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