parseQubicBlocks(rqubic)
parseQubicBlocks()所属R语言包:rqubic
Parse QUBIC Command Line Tool Output Files
解析QUBIC命令行工具的输出文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
These functions parse output files of the QUBIC command line tool developed by Ma et al.
这些功能解析马等的QUBIC命令行开发工具的输出文件。
用法----------Usage----------
parseQubicRules(filename)
parseQubicChars(file, check.names=FALSE, ...)
parseQubicBlocks(filename)
参数----------Arguments----------
参数:filename
Input filename
输入文件名
参数:file
Input filename
输入文件名
参数:check.names
logical, should the column names be checked?
逻辑,应进行检查列名?
参数:...
other parameters passed to the read.csv function
其他参数传递给read.csv函数
Details
详情----------Details----------
Parse QUBIC Command Line Tool Output Files
解析QUBIC命令行工具的输出文件
值----------Value----------
parseQubicRules and parseQubicChars both return a data frame.
parseQubicRules和parseQubicChars都返回一个数据框。
parseQubicBlocks returns an instance of QUBICBiclusterSet class.
parseQubicBlocks返回QUBICBiclusterSet类的实例。
作者(S)----------Author(s)----------
Jitao David Zhang <jitao_david.zhang@roche.com>
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
getRqubicFile <- function(filename) system.file("extdata", filename, package="rqubic")
## parse QUBIC rules[#解析QUBIC规则]
rule.file <- getRqubicFile("sampleExpressionSet.rules")
rqubic.sample.rule <- parseQubicRules(rule.file)
## parse QUBIC chars[#解析QUBIC字符]
chars.file <- getRqubicFile("sampleExpressionSet.chars")
rqubic.sample.chars <- parseQubicChars(chars.file)
## parse QUBIC blocks[#解析QUBIC块]
block.file <- getRqubicFile("sampleExpressionSet.blocks")
rqubic.sample.data <- parseQubicBlocks(block.file)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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