interactorInfo(RpsiXML)
interactorInfo()所属R语言包:RpsiXML
Interactor info in a matrix
在矩阵interactor信息
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function returns the essential information of interactors in a matrix. Xrefs are left out since they have arbitrary numbers of annotation and cannot be summarized into a matrix.
该函数返回一个矩阵团团员基本信息。外部参照冷落,因为他们有任意数量的注释,并不能概括成一个矩阵。
用法----------Usage----------
interactorInfo(x)
参数----------Arguments----------
参数:x
An object which contains psimi25Interactor information, for example objects of psimi25InteractionEntry-class, psimi25Graph-class, psimi25Hypergraph-class or psimi25ComplexEntry-class </table>
一个对象其中包含psimi25Interactor信息,psimi25InteractionEntry-class,psimi25Graph-class,psimi25Hypergraph-class或psimi25ComplexEntry-class</表>例如对象
值----------Value----------
A matrix of interactor information, each row represents an interactor The columns are
一个interactor信息矩阵,每一行代表一个interactor列
参数:sourceDb
source database
源数据库
参数:sourceId
source database index
源数据库索引
参数:shortLabel
short label assigned by the source database
源数据库分配的短标签
参数:uniprotId
UniProt ID, NA if not available
UniProt编号,NA如果没有可用
参数:organismName
the organism of the interactor protein
的interactor蛋白的有机体
作者(S)----------Author(s)----------
Jitao David Zhang <jitao_david.zhang@roche.com>
参见----------See Also----------
xref, availableXrefs
xref,availableXrefs
举例----------Examples----------
xmlDir <- system.file("/extdata/psi25files",package="RpsiXML")
hprdxml <- file.path(xmlDir, "hprd_200709_test.xml")
hprdSet <- parsePsimi25Interaction(hprdxml, HPRD.PSIMI25)
hprdInteractorInfo <- interactorInfo(hprdSet)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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