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R语言 RPA包 RPA.preprocess()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:21:40 | 显示全部楼层 |阅读模式
RPA.preprocess(RPA)
RPA.preprocess()所属R语言包:RPA

                                        Preprocess AffyBatch object for RPA.
                                         为爱国军的预处理AffyBatch对象。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Background correction, quantile normalization and log2-transformation for probe-level raw data in abatch. Then probe-level differential expression is computed between the specified
背景校正,探针abatch级原始数据的log2位数标准化和改造。然后计算之间的指定探针水平的差异表达


用法----------Usage----------


                      normalization.method = "quantiles.robust",
                      cdf = NULL,



参数----------Arguments----------

参数:abatch
An AffyBatch object.
一个AffyBatch对象。


参数:bg.method
Specify background correction method. See bgcorrect.methods(abatch) for options.
指定背景校正方法。见选项bgcorrect.methods(abatch)。


参数:normalization.method
Specify normalization method. See normalize.methods(abatch) for options. For memory-efficient online version, use "quantiles.online".
指定标准化的方法。见选项normalize.methods(abatch)。对于内存高效的在线版本,使用“quantiles.online”。


参数:cdf
The CDF environment used in the analysis.
民防部队的环境中使用的分析。


参数:cel.files
List of CEL files to preprocess.
名单CEL文件进行预处理。


参数:cel.path
Path to CEL file directory.
CEL的文件目录的路径。


Details

详情----------Details----------

Probe-specific variance estimates are robust against the choice
强大的反对选择探测特定的方差估计


值----------Value----------


参数:fcmat
Probes x arrays preprocessed differential expression matrix.
探针x阵列的差异表达矩阵预处理。


参数:cind
Specifies which array in abatch was selected as a reference in calculating probe-level differential expression.
指定阵列abatch作为参考计算探针水平的差异表达的选择。


参数:cdf
The CDF environment used in the analysis.
民防部队的环境中使用的分析。


参数:set.inds
Indices for probes in each probeset, corresponding to the rows of fcmat.
指数为探针,每个probeset对应的fcmat行。


作者(S)----------Author(s)----------


Leo Lahti <leo.lahti@iki.fi>



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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