ZScorePlotTwo(RNAither)
ZScorePlotTwo()所属R语言包:RNAither
Plot signal intensities per well (II)
每口井的的图信号强度(二)
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots signal intensity values for each well, a black line showing the median, two green lines showing one median absolute deviation, two red lines showing two median absolute deviations.
小区信号强度值,每口井,一条黑线,中位数显示,两个显示一个中位数绝对偏差,两个显示两个位数的绝对偏差的红线绿线。
用法----------Usage----------
ZScorePlotTwo(header, dataset, flag, flag2, col4plot, col4anno, plotTitle, showPlot)
参数----------Arguments----------
参数:header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile
数据集文件头生成的以generateDatasetFile
参数:dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile
R的数据框生成的以generateDatasetFile
参数:flag
0, 1, or 2. 0 uses the data from the complete dataset, 1 generates one plot for each experiment, 2 generates one plot for each plate.
0,1或2。 0使用从完整的数据集的数据,1生成一个图形每个实验,2生成每块板的一个图。
参数:flag2
0 draws lines using mean and sd, 1 draws lines using median and mad.
0使用均值和SD画线,画线用中位数和疯狂。
参数:col4plot
a character string specifying the column whose intensity values will be used for the plot
一个字符串,指定列,其强度值将用于积
参数:col4anno
in case showPlot == 1, a character string specifying the column used for identifying points
在案例showPlot == 1,字符串指定列用于识别点
参数:plotTitle
the plot title
图标题
参数:showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows.
0或1。 1将在一个或几个小区的R GUI窗口打开,0只保存不打开窗户图(S)。
值----------Value----------
Saves the plots in pdf and png files named after the experiment name specified in the header concatenated with the plotTitle and if applicable the experiment number and/or the plate number.
图串连头中指定的实验名称命名的PDF和PNG文件保存 plotTitle“如果适用的实验数量和/或车牌号码。
When flag == 0, returns the plot name (plotName).
当flag== 0,返回小区名称(plotName)。
When flag == 1, returns a list containing:
当flag== 1,返回一个列表,其中包含:
参数:plotName
The plot name
图名称
参数:minOfScreens
The number of the first experiment
第一实验数
参数:numOfScreens
The number of the last experiment
最后的实验数
When flag == 2, returns a list containing: the plot name, a vector with the number of the first experiment and of the last experiment, and a vector with the number of the first plate and the number of the last plate.
当flag== 2,返回一个列表,其中包含:小区名称,向量的第一个实验中,最后的实验,并与第一盘数量的向量和数量的最后板。
参见----------See Also----------
plotBar, ZScorePlot
plotBar,ZScorePlot
举例----------Examples----------
data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")
plotname <- ZScorePlotTwo(header, dataset, 0, 1, "SigIntensity", "GeneName", "Data per well", 0)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|