R语言 RNAither包 vennDiag()函数中文帮助文档(中英文对照)

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vennDiag(RNAither)
vennDiag()所属R语言包：RNAither

                                         Plotting a Venn Diagram to compare hits
                                         绘制维恩图比较命中

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots a Venn Diagram of up to three binary hit vectors.
绘制维恩图三个二进制命中向量。


用法----------Usage----------


vennDiag(header, listOfCols, listOfNames, plotTitle, showPlot)



参数----------Arguments----------

参数：header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件头生成的以generateDatasetFile


参数：listOfCols
a list of binary hit vectors to compare  
列表的二进制命中向量的比较


参数：listOfNames
a list of character strings for the annotation of the Venn Diagram  
为的维恩图的注释字符串列表


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


参数：showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows  
0或1。 0 1会打开一个或几个在R GUI窗口图，将只保存不打开窗户图（）


值----------Value----------

The plot is saved in a pdf and a png file named after the experiment name specified in the header concatenated with the  plotTitle.
图被保存在PDF和PNG文件后的头在 plotTitle串联指定的实验名称命名。

The function returns the plot name.
该函数返回小区名称。


参见----------See Also----------

Ttest, MannWhitney
Ttest，MannWhitney


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")

data(pValVec1, package="RNAither")
data(pValVec2, package="RNAither")
data(scoredDataset1, package="RNAither")
data(scoredDataset2, package="RNAither")

##for details on the generation of pValVec and scoredDataset, [＃一代pValVec和scoredDataset，]
##see the examples of the functions Ttest and MannWhitney linked above.[＃TTEST和MannWhitney上面链接的功能的例子。]

scoredHits1 <- hitselectionPval(scoredDataset1, pValVec1, "SigIntensity", "pValue.ttest_l", 0.05,
"GeneName", "pvalue_testfile1.txt")

scoredHits2 <- hitselectionPval(scoredDataset2, pValVec2, "SigIntensity", "pValue.mannwhitney_l", 0.05,
"GeneName", "pvalue_testfile2.txt")

hitvector1 <- scoredHits1[[2]]
hitvector2 <- scoredHits2[[2]]

plot_name <- vennDiag(header, list(hitvector1, hitvector2), list("t test", "Mann-Whitney test"),
"Venn diagram", 1)

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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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