R语言 RNAither包 SNRQualControl()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

SNRQualControl(RNAither)
SNRQualControl()所属R语言包：RNAither

                                         Computing the SNR
                                         计算信噪比

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computes the signal to noise ratio for all data, per experiment and per plate for a complete dataset file and plots histograms of the results.
计算信号噪声比所有的数据，每一个完整的数据集文件和图的结果直方图的实验和每盘。


用法----------Usage----------


SNRQualControl(dataSetFile, nbLinesHeader, channel, noise, plotTitle, showPlot)



参数----------Arguments----------

参数：dataSetFile
a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件生成的以generateDatasetFile


参数：nbLinesHeader
typically 3  
通常为3


参数：channel
a character string specifying the name of the column containing the values for computing the SNR, e.g. "SigIntensity"  
计算信噪比字符串指定包含值的列的名称，例如： "SigIntensity"


参数：noise
A character string specifying the name of the column containing the values for computing the SNR, e.g. "Background"  
一个字符串，指定包含值的列的名称，如计算信噪比"Background"


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


参数：showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows  
0或1。 0 1会打开一个或几个在R GUI窗口图，将只保存不打开窗户图（）


值----------Value----------

Shows histogram plots of the SNR for the whole dataset file, per experiment and per plate and saves them in a pdf file. The name of the file will be the concatenation of the experiment name specified in the header and the function argument  plotTitle.
显示直方图图为整个数据文件的信噪比，每个实验和每盘，并把它们保存在一个PDF文件。该文件的名称将是标头中指定实验名称的串联和函数的参数 plotTitle。


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")
saveDataset(header, dataset, "save_testfile1.txt")

SNRQualControl("save_testfile1.txt", 3, "SigIntensity", "Background", "SNR", 1)

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