replicatesCV(RNAither)
replicatesCV()所属R语言包:RNAither
Compute the correlation of variation (CV)
计算的相关变化(简历)
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes the correlation of variation as defined in Tseng et al. (see References)
计算井等所界定的相关变化。 (见参考资料)
用法----------Usage----------
replicatesCV(header, dataset, PlotTitle, col4val, col4anno, plotDesign, showPlot)
参数----------Arguments----------
参数:header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile
数据集文件头生成的以generateDatasetFile
参数:dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile
R的数据框生成的以generateDatasetFile
参数:PlotTitle
the plot title
图标题
参数:col4val
a character string specifying the column whose values will be used to compute the correlation of variation
一个字符串,指定列的值将被用来计算变异的相关性
参数:col4anno
a character string specifying the name of the dataset column to be used to define the replicate, e.g. "GeneName" or "Internal_GeneID"
一个字符串指定的被用来定义复制数据集列的名称,如 "GeneName"或 "Internal_GeneID"
参数:plotDesign
1 or 2. 1 will generate one window containing all plots, 2 will generate a series of plots.
1或2。 1,将生成一个窗口,其中包含的所有图,将产生一系列图。
参数:showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows.
0或1。 1将在一个或几个小区的R GUI窗口打开,0只保存不打开窗户图(S)。
值----------Value----------
The correlation of variation of an siRNA is defined as the standard deviation of its values divided by their mean.
他们的平均分为其值的标准偏差被定义为一个siRNA变化的相关性。
The function generates a plot of the average intensity against the CV for each experiment. The plot will be saved as a pdf and a png file named after the experiment name specified in the header concatenated with the PlotTitle.
函数生成对简历的平均强度的图,每一个实验。该图将被保存为PDF和PNG文件后的头在 PlotTitle串联指定的实验名称命名。
The function returns a list containing:
该函数返回一个列表,其中包含:
参数:histoName
the plotname
在plotname
参数:minOfScreens
the number of the first experiment
第一实验
参数:numOfScreens
the number of the last experiment
最后的实验数
参考文献----------References----------
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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