R语言 RNAither包 incorporatepValVec()函数中文帮助文档(中英文对照)

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incorporatepValVec(RNAither)
incorporatepValVec()所属R语言包：RNAither

                                         Incorporate a vector of p-values into a dataset
                                         纳入矢量数据集的p-值

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Incorporates a vector of p-values into a dataset. Also works with a dataset containing values per well (non summarized), or with a hit vector.
合并到一个数据集的p-值的向量。也可以用一个包含每井（非汇总），或与一击向量的值的数据集。


用法----------Usage----------


incorporatepValVec(dataset, pValVec, replicaMatrix, col4anno, colname4pval)



参数----------Arguments----------

参数：dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数：pValVec
a vector of p-values  
p值向量


参数：replicaMatrix
a matrix of replicate values, as generated by generateReplicateMat  
矩阵的重复值，生成generateReplicateMat


参数：col4anno
a character string specifying the name of the dataset column to be used to define the replicate, for example  "GeneName" or  "Internal_GeneID"  
字符串指定被用来定义复制数据集的列的名称，例如， "GeneName"或 "Internal_GeneID"


参数：colname4pval
a character string specifying the name of the dataset column the p-values will be stored in  
一个字符串，指定数据集的列的名称P-值将存储在


值----------Value----------

Returns the dataset with an added column of p-values.
返回p值列集。


参见----------See Also----------

multTestAdjust, Ttest
multTestAdjust，Ttest


举例----------Examples----------


data(exampleDataset, package="RNAither")

data(scoredDataset1, package="RNAither")
##scoredDataset1 already contains the p-value column[＃scoredDataset1已经包含了P-值列]
data(pValVec1, package="RNAither")

##for details on the generation of pValVec1 and scoredDataset1, see the example of the Ttest function linked above.[＃上一代的pValVec1和scoredDataset1的详细信息，请参阅以上链接的TTEST函数的例子。]

temp <- generateReplicateMat(dataset, 1, "Intensities", "SigIntensity",  "GeneName")
replicamatrix <- temp[[1]]
newdataset <- incorporatepValVec(dataset, pValVec1, replicamatrix, "GeneName", "pvals")
##newdataset and scoredDataset1 are now equivalent[现在相当于＃newdataset和scoredDataset1]


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