R语言 RNAither包 gseaAnalysis()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gseaAnalysis(RNAither)
gseaAnalysis()所属R语言包：RNAither

                                         Perform a GSEA analysis of a list of genes
                                         执行GSEA分析基因列表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Performs a GSEA analysis of a list of genes using the package  topGO (see References).
执行使用包 topGO（见参考资料）的基因名单GSEA分析。


用法----------Usage----------


gseaAnalysis(hitVector, whichOnto)



参数----------Arguments----------

参数：hitVector
a named hit vector as generated by hitselectionZscore or hitselectionPval  
一个名为命中矢量生成hitselectionZscore或hitselectionPval


参数：whichOnto
One of the three GO ontologies:  "biological_process",  "molecular_function" or  "cellular_component"  
其中，三个基因本体： "biological_process"， "molecular_function"或 "cellular_component"。


值----------Value----------

A table containing the enriched GO terms and their significance.
一个表中含有丰富的GO术语及其意义。


参考文献----------References----------


<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


data(scoredDataset1, package="RNAither")
data(pValVec1, package="RNAither")

##for details on the generation of pValVec1 and scoredDataset1, see the example of the Ttest function linked above.[＃上一代的pValVec1和scoredDataset1的详细信息，请参阅以上链接的TTEST函数的例子。]

scoredHits1 <- hitselectionPval(scoredDataset1, pValVec1, "SigIntensity", "Hits1", 0.1,
"GeneName", "pvalue_testfile1.txt")
hitVector1 <- scoredHits1[[2]]
gseaTable <- gseaAnalysis(hitVector1, "biological_process")


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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