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R语言 RNAither包 divNorm()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:10:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
divNorm(RNAither)
divNorm()所属R语言包:RNAither

                                         Mean, median, ... , normalization
                                         平均数,中位数... ,规范化;

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Normalization with the mean, median, or any other function.
与平均数,中位数,或任何其他功能的标准化。


用法----------Usage----------


divNorm(header, dataset, listOfArgs)



参数----------Arguments----------

参数:header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件头生成的以generateDatasetFile


参数:dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数:listOfArgs
a list containing:   - a character string specifying the column whose values will be used for normalization  - a function to be used for the normalization, e.g.  mean,  median, ...  - 1 or 2, 1 meaning a normalization per experiment, 2 meaning a normalization per plate  - 1 or 2, 1 meaning the normalization is achieved by a division of the intensity values by the outcome of  funname, 2, meaning by a substraction  - a flag specifying whether controls should be excluded for the computation of the result of the function specified in the first element (1) or not (0).  
一个列表,其中包含: - 一个字符串,指定列的值将被用于标准化 - 标准化的功能,例如:  mean, median,... -  1或2,这意味着每个实验,2标准化,这意味着每盘的标准化 -  1或2,1意味着标准化 funname2的结果是由分工的强度值达到,意思1减法 - 指定是否控制结果中的第一个元素(1)或(0)指定的函数的计算应排除的一个标志。


值----------Value----------

Returns a list containing:
返回一个列表,其中包含:


参数:header
the new header (with an added entry about the normalization procedure in the comments)  
新的头(与有关标准化过程中添加条目的意见)


参数:dataset
the new dataset with normalized values. The old values are saved in an extra column with the suffix ".old"  
新的数据集与标准化值。旧值保存在一个额外的后缀列的“老”


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")

normres <- divNorm(header, dataset, list(median, 2, 1, "SigIntensity", 1))

newheader <- normres[[1]]
newdataset <- normres[[2]]


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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