R语言 RNAither包 controlDensity()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

controlDensity(RNAither)
controlDensity()所属R语言包：RNAither

                                         Plotting the control density
                                         绘制控制密度

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the density of positive and negative controls (if applicable) for all controls contained in the dataset.
阳性和阴性对照图的密度（如适用）在DataSet中包含的所有控件。


用法----------Usage----------


controlDensity(header, dataset, channel, plotTitle, showPlot, supHisto)



参数----------Arguments----------

参数：header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件头生成的以generateDatasetFile


参数：dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数：channel
a character string specifying the name of the column containing the values for computing the density, e.g. "SigIntensity"  
密度计算指定字符串包含值的列的名称，例如： "SigIntensity"


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


参数：showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows  
0或1。 0 1会打开一个或几个在R GUI窗口图，将只保存不打开窗户图（）


参数：supHisto
0 or 1. 1 will additionally superimpose a colour histogram of the values for the positive and negative controls. Otherwise choose 0.
0或1。 1将另外叠加的颜色直方图为阳性和阴性对照值。否则，选择0。


值----------Value----------

Plots the density of positive and negative controls (if applicable) for all controls contained in the dataset. The plot is saved as a pdf and a png file named after the experiment name specified in the header concatenated with the  plotTitle.
阳性和阴性对照图的密度（如适用）在DataSet中包含的所有控件。图保存为PDF和PNG文件后的头在 plotTitle串联指定的实验名称命名。

The function returns the plot name.
该函数返回小区名称。


参见----------See Also----------

controlDensityPerScreen, controlDensityPerPlate
controlDensityPerScreen，controlDensityPerPlate


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")

controlDensity(header, dataset, "SigIntensity", "Control density", 1, 1)

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