R语言 RNAither包 compareReplicateSDPerScreen()函数中文帮助文档(中英文对照)

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compareReplicateSDPerScreen(RNAither)
compareReplicateSDPerScreen()所属R语言包：RNAither

                                         Plot the standard deviation of replicates for each experiment
                                         每个实验的重复绘制标准偏差

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

In the same fashion as spatialDistrib, generates plots of the standard deviation of replicate values for each experiment.
以同样的方式为spatialDistrib，生成每个实验的复制值的标准偏差的图。


用法----------Usage----------


compareReplicateSDPerScreen(header, dataset, plotTitle, colname4SD, col4anno, showPlot)



参数----------Arguments----------

参数：header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件头生成的以generateDatasetFile


参数：dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


参数：colname4SD
a character string specifying the column whose values will be used for the computation of the replicate standard deviation  
一个字符串，指定列的值将复制的标准偏差的计算使用


参数：col4anno
a character string specifying the name of the dataset column to be used to define the replicate, e.g.  "GeneName" or  "Internal_GeneID"  
一个字符串指定的被用来定义复制数据集列的名称，如 "GeneName"或 "Internal_GeneID"


参数：showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows  
0或1。 0 1会打开一个或几个在R GUI窗口图，将只保存不打开窗户图（）


值----------Value----------

Generates plots of the standard deviation of replicate values for each experiment. The plots are saved as png files named after the experiment name specified in the header concatenated with the  plotTitle and the number of the experiment.
生成的每个实验重复值的标准偏差的图。图保存为png文件后 plotTitle和实验串连头中指定的实验名称命名。

Wells showing positive controls sd are marked with a "P", wells showing negative controls sd with an "N".
标有“P”字，显示一个“N”SD阴性对照井井显示阳性对照SD。

The plots will also be saved as html files containing mouse-overs with the siRNA name for each well.
图也将被保存为HTML文件，每口井的siRNA名称含有鼠标接管。

The function returns a list of length 3 containing:
该函数返回一个长度为3个含有名单：


参数：basicPlotName
the plot name
小区名称


参数：minOfScreens
the number of the first experiment
第一实验


参数：numOfScreens
the number of the last experiment
最后的实验数


参见----------See Also----------

spatialDistrib, compareReplicateSD
spatialDistrib，compareReplicateSD


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")

compareReplicateSDPerScreen(header, dataset, "Replicate standard intensity deviation",
"SigIntensity", "GeneName", 1)

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