R语言 RNAither包 compareReplicateSD()函数中文帮助文档(中英文对照)

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compareReplicateSD(RNAither)
compareReplicateSD()所属R语言包：RNAither

                                         Plot the standard deviation of replicates
                                         绘制复制的标准偏差

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

In the same fashion as spatialDistrib, generates a plot of the standard deviation of replicate values.
以同样的方式spatialDistrib，产生一个重复值的标准偏差的图。


用法----------Usage----------


compareReplicateSD(header, dataset, plotTitle, colname4SD, col4anno, showPlot)



参数----------Arguments----------

参数：header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件头生成的以generateDatasetFile


参数：dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


参数：colname4SD
a character string specifying the column whose values will be used for the computation of the replicate standard deviation  
一个字符串，指定列的值将复制的标准偏差的计算使用


参数：col4anno
a character string specifying the name of the dataset column to be used to define the replicate, e.g.  "GeneName" or  "Internal_GeneID"  
一个字符串指定的被用来定义复制数据集列的名称，如 "GeneName"或 "Internal_GeneID"


参数：showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows  
0或1。 0 1会打开一个或几个在R GUI窗口图，将只保存不打开窗户图（）


值----------Value----------

Generates a plot of the standard deviation of replicate values of all experiments. The plot is saved as a png file named after the experiment name specified in the header concatenated with the  plotTitle.
生成的所有实验重复值的标准偏差的图。该图后的头在 plotTitle串联指定的实验名称命名的png文件保存为。

Wells showing positive controls sd are marked with a "P", wells showing negative controls sd with an "N".
标有“P”字，显示一个“N”SD阴性对照井井显示阳性对照SD。

The plot will also be saved as an html file containing mouse-overs with the siRNA name for each well.
图也将被保存为一个HTML文件，为每口井的siRNA名称含有鼠标接管。

The function returns the plotname.
函数返回plotname。


参见----------See Also----------

spatialDistrib, compareReplicateSDPerScreen
spatialDistrib，compareReplicateSDPerScreen


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")

compareReplicateSD(header, dataset, "Replicate standard intensity deviation",
"SigIntensity", "GeneName", 1)

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