R语言 RNAither包 compareReplicates()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

compareReplicates(RNAither)
compareReplicates()所属R语言包：RNAither

                                         Compare replicate values
                                         比较重复值

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots replicate intensities pairwise for each experiment.
图复制成对每个实验的强度。


用法----------Usage----------


compareReplicates(header, dataset, plotTitle, col4val, col4anno, plotDesign, showPlot)



参数----------Arguments----------

参数：header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件头生成的以generateDatasetFile


参数：dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


参数：col4val
a character string specifying the column whose values will be used for the plot  
一个字符串，指定列的值将被用于为图


参数：col4anno
a character string specifying the name of the dataset column to be used to define the replicate, e.g.  "GeneName" or  "Internal_GeneID"  
一个字符串指定的被用来定义复制数据集列的名称，如 "GeneName"或 "Internal_GeneID"


参数：plotDesign
1 or 2. 1 will generate one window containing all plots, 2 will generate a series of plots  
1或2。 1将生成一个窗口，其中包含所有的图，会产生一系列图


参数：showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows  
0或1。 0 1会打开一个或几个在R GUI窗口图，将只保存不打开窗户图（）


值----------Value----------

For each experiment, plots of pairwise comparisons between replicate intensities are generated and saved as a pdf and a png file named after the experiment name specified in the header concatenated with the  plotTitle, and the number of the experiment.
对于每个实验，复制强度之间的成对比较图生成和保存为PDF和PNG文件后 plotTitle，实验串连头中指定的实验名称命名的。

The function returns a list containing:
该函数返回一个列表，其中包含：


参数：plotName
the plot name  
小区名称


参数：minOfScreens
the number of the first experiment  
第一实验


参数：numOfScreens
the number of the last experiment  
最后的实验数


参数：maxCombinationNum
the number of replicates to compare  
数复制到比较


参见----------See Also----------

compareReplicaPlates
compareReplicaPlates


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")

compareReplicates(header, dataset, "Comparison of Replicates", "SigIntensity", "GeneName", 1, 0)

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