plotHeatmap(RNAinteract)
plotHeatmap()所属R语言包：RNAinteract
plots a heatmap for an interaction screen.
一个互动屏幕上绘制热图。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A heatmap of an interaction screen is plotted.
一个互动屏幕的热图绘制。
用法----------Usage----------
plotHeatmap(sgi, screen, channel, pi.max = NULL,
main = expression(paste(pi, "-score")),
hc.row = NULL, hc.col = NULL,
withoutgroups = c("neg", "pos"))
参数----------Arguments----------
参数：sgi
An object of class RNAinteract
一个对象的类RNAinteract
参数：screen
The screen name of which the interaction matrix is plotted.
相互作用矩阵绘制的屏幕名称。
参数：channel
The channel name of which the interaction matrix is plotted.
频道名称的相互作用矩阵绘制。
参数：pi.max
The pairwise interaction score that is represented at the top of the color scale. All interaction scores above this value can not be distinguished any more.
成对的相互作用得分的在色阶顶部代表。高于此值的所有互动分数不能被任何区别。
参数：main
The title of the plot.
图的标题。
参数：hc.row
A hierarchical clustering (hclust) for the rows.
层次聚类（hclust）行。
参数：hc.col
A hierarchical clustering (hclust) for the columns.
层次聚类（hclust）列。
参数：withoutgroups
The genes within this group are not shown in the heatmap. It is convinient to hide screen controls in the heatmap.
在这一组中的基因不会显示在热图。这是方便易隐藏在屏幕控制的热图。
Details
详情----------Details----------
A heatmap for one screen and one channel is plotted. Positive interactions are marked blue, negative ones are marked yellow. A colorbar is shown on the left hand side.
一个屏幕和一个通道的热图绘制。蓝色的，消极的良性互动标记，被标记为黄色。一个彩条显示在左侧。
值----------Value----------
Returns a grob.
返回格罗。
作者（S）----------Author(s)----------
Bernd Fischer
参见----------See Also----------
RNAinteract-package
RNAinteract-package
举例----------Examples----------
data("sgi")
plotHeatmap(sgi, screen="1", channel="nrCells")
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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 13:07:13
