normalizePlateEffect(RNAinteract)
normalizePlateEffect()所属R语言包:RNAinteract
Normalization of plate effects
板块效应的标准化
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Normalization of plate effects in the screen.
在屏幕上的板块效应的标准化。
用法----------Usage----------
normalizePlateEffect(sgi, type = "Bscore", maxit = 20, verbose = 0)
参数----------Arguments----------
参数:sgi
An object of class RNAinteract
一个对象的类RNAinteract
参数:type
If type is "Bscore" (default) a Bscore-normalization is performed. If type is "spatial", a locfit regression is estimated that accounts for spatial effects.
如果类型是“Bscore”(默认)1 Bscore标准化。如果类型是“空间”,locfit回归估计,占的空间效果。
参数:maxit
Maximum number of iterations for locfit.
locfit迭代的最大数量。
参数:verbose
Either 0 (default, no output), 1 (minimum output), or 2 (outout).
0(默认情况下,没有输出),1(最小输出),或2(outout)。
Details
详情----------Details----------
The Bscore normalization estimates row and column effects for each plate. It returns the residuals to the sum of row and column effects. The spatial normalization estimates a non-linear 2D regression for each plate and returns the residuals.
Bscore标准化估计每个板块的行和列的影响。它返回的残差行和列效应的总和。空间标准化估计为每块板的非2D线性回归和返回的残差。
值----------Value----------
An object of class RNAinteract. The returned object contains the normalization information.
对象类RNAinteract。返回的对象包含了标准化的信息。
作者(S)----------Author(s)----------
Bernd Fischer
参见----------See Also----------
RNAinteract-package
RNAinteract-package
举例----------Examples----------
data("sgi")
normalizePlateEffect(sgi)
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注:
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