R语言 RNAinteract包 grid.sgiHeatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

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grid.sgiHeatmap(RNAinteract)
grid.sgiHeatmap()所属R语言包：RNAinteract

                                         A heatmap grob
                                         一个热图GROB

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A grob is created and printed for a matrix PI which is intended to represent pairwise interaction scores.
创建并打印一个GROB矩阵有价证券，这是为了表示对相互作用的分数。


用法----------Usage----------


grid.sgiHeatmap(PI, pi.max = NULL, main = expression(paste(pi, "-score")),
                hc.row = NULL, hc.col = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：PI
A matrix of pairwise interactions.
成对相互作用矩阵。


参数：pi.max
The interaction score at the top end of the colorbar. pairwise interaction score larger than this value can not be distinguished anymore.
在高端的彩条的相互作用得分。成对相互作用得分大于这个值无法区分了。


参数：main
A title for the plot.
图的标题。


参数：hc.row
An hierarchical clustering as produced by hclust of the rows.
作为一个层次聚类由行hclust生产。


参数：hc.col
Clustering of the columns.
聚类列。


Details

详情----------Details----------

A heatmap is plotted with positive interaction represented in yellow and negative interactions represented in blue. A colorbar is plotted on the left and dendrograms are added. This function can be used to integrate the plot in other grid objects. It is recommended to use the function plotHeatmap to plot heatmaps of an RNAinteract object.
一个热图绘制代表黄色和蓝色代表负相互作用的良性互动。左侧绘制一个彩条和聚类添加。此功能可用于集成在其他网格对象的图。这是推荐使用的功能plotHeatmap到RNAinteract对象绘制热图。


值----------Value----------

A grob is returned.
返回一个GROB。


作者（S）----------Author(s)----------



Bernd Fischer




参见----------See Also----------

RNAinteract-package
RNAinteract-package


举例----------Examples----------


data("sgi")
PI = getData(sgi, type="pi", format="targetMatrix", screen="1", channel="nrCells")
grid.sgiHeatmap(PI)

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