R语言 RNAinteract包 grid.doublePerturbation()函数中文帮助文档(中英文对照)

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grid.doublePerturbation(RNAinteract)
grid.doublePerturbation()所属R语言包：RNAinteract

                                         Double Perturbation Plot Grob
                                         双扰动图格罗

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions create a double perturbation grob for interaction screens. All interactions of one gene are displayed in one panel. The double perturbation readout level is plotted against the single perturbation level.
这些功能创造一个互动屏幕的双扰动GROB。一个基因的所有交互显示在一个小组。双扰动读数水平绘制对单一扰动水平。


用法----------Usage----------


doublePerturbationGrob( mainEffect, dpEffect, mainEffectTarget,
                       range=NULL, main=NULL, xlab=NULL, ylab=NULL,
                       text=NULL, avoid.overlap=TRUE,
                       axisOnOrigin = FALSE,
                       drawBox = TRUE,
                       pch = 21, size=unit(1, "char"), fill = NULL,
                       gpMain = gpar(lty="dashed", lwd=3, col="cyan"),
                       gpNI = gpar(lty="dashed", lwd=3, col="orange"),
                       gpPoints = gpar(pch=21),
                       gpText = NULL,
                       gpAxis = NULL,
                       gpWTLines=NULL,
                       name=NULL, gp=NULL, vp=NULL )
grid.doublePerturbation(..., draw = TRUE)

# a helper function for doublePerturbationGrob:
postDrawDetails.doublePerturbation(x, recording)



参数----------Arguments----------

参数：mainEffect
A numeric vector of main effects.  
数字向量的主要影响。


参数：dpEffect
A numeric vector of double perturbation effects.  
一个双重扰动影响的数值向量。


参数：mainEffectTarget
The main effect of the target gene (A single numeric value).  
主要作用的靶基因（单一数值）。


参数：range
The range of the plot. Equals the xlim, ylim arguments of plot.  
该图的范围内。等于xlim，ylimplot参数。


参数：main
An overall title of the plot.
一个总冠军的图。


参数：xlab
A title of the x-axis.
x轴的标题。


参数：ylab
A title of the y-axis.
y轴的标题。


参数：text
A character vector of text. Has to have the same length as mainEffect.
一个文本的特征向量。必须具有相同的长度为mainEffect。


参数：avoid.overlap
If TRUE (default) the text labels are moved such that the text is not overlapping.
TRUE如果（默认值）文本标签被移到这样的文本不重叠。


参数：axisOnOrigin
If TRUE, the x- and y-axis are draw on the origin of the data. If FALSE (default), the axis are drawn on the left and on the bottom.
如果TRUE，x和y轴绘制的数据来源。 FALSE如果（默认），轴画的左边和底部。


参数：drawBox
If TRUE (default), a box is drawn around the plot.
如果TRUE（默认），一箱周围的图绘制。


参数：pch
Either an integer specifying a symbol or a single character to be used in plotting points. See points for possible values.
一个整数，指定一个符号或一个单一的字符被用于绘制点。看到points可能的值。


参数：size
A unit object specifying the size of the plotting symbols.
A股对象指定的图形符号的大小。


参数：fill
A list containing (some of) the following elements: col defines a fill color for the points. Either a single value or a vector of the same length as mainEffect. If col is defined, all other elements of fill have no effect. values is a numeric vector of the same length as mainEffcet that contains values that are mapped to colors.  at is a numeric vector indicating breakpoints along the values. If not specified will be equally spaced on the range of the values. colors defines a set of colors from which a colorramp is created. colramp defines a colorramp directly. colramp has no effect, if colors is defined.  
列表含有下列要素（部分）：col定义一个点的填充颜色。无论是单值或为mainEffect相同长度的向量。如果col定义，填补所有其他元素没有任何效果。 values是mainEffcet，包含映射到颜色的值相同长度的数字向量。 at是一个数值向量，指示沿值的断点。如果没有指定将等距离范围值。 colors定义的，从中colorramp创建颜色的集合。 colramp定义一个colorramp直接的。 colramp有没有效果，如果colors定义。


参数：gp
An object of class gpar, typically the output from a call to the function gpar. This is basically a list of graphical parameter settings. Overall settings for the plot are set in gp.   
一个类的对象gpar，通常从调用输出函数gpar。这基本上是一个图形参数设置列表。整体图设置被设置在gp。


参数：gpMain,gpNI
An object of class gpar (See gp). gpMain and gpNI indicate the graphics parameter for the main effect lines and the non-interacting line.  
一个类的对象gpar（见gp）。 gpMain和gpNI表明主要作用线的图形参数和非相互作用的线。


参数：gpPoints,gpText,gpAxis,gpWTLines
An object of class gpar (See gp). These arguments define graphical parameters for single compartments of the plot.  
一个类的对象gpar（见gp）。这些参数定义为单一的图车厢图形参数。


参数：name
A character identifier.
字符识别。


参数：vp
A Grid viewport object (or NULL).
一个网格视口对象（或NULL）。


参数：draw
If TRUE the grob is drawn on the current device.
如果TRUEGROB当前设备上绘制。


参数：...
Further arguments passed to doublePerturbationGrob.
进一步的参数传递到doublePerturbationGrob。


参数：x, recording
Internal usage only.
仅限内部使用。


Details

详情----------Details----------

This function creates a grob for a double perturbation plot. It is probably more convenient to use the function plotDoublePerturbation.
这个函数创建一个双扰动图GROB。这可能是更方便地使用功能plotDoublePerturbation。


值----------Value----------

A grob is returned.
返回一个GROB。


作者（S）----------Author(s)----------



Bernd Fischer




参见----------See Also----------

RNAinteract-package, plotDoublePerturbation, reportDoublePerturbation
RNAinteract-package，plotDoublePerturbation，reportDoublePerturbation

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