getReplicateData(RNAinteract)
getReplicateData()所属R语言包:RNAinteract
Extract replicates measurements from the screen.
提取复制从屏幕上的测量。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A genetic interaction screen can contain within screen replicates, if some reagent pairs are measured at least twice. Usually this appears when measuring reagent pairs once as template-query and once as query-template. getReplicateData returns a list of these technical replicates.
遗传相互作用屏幕可以包含在屏幕复制,如果一些试剂对至少测量两次。这通常出现一次测量模板查询,一旦查询模板的试剂对。 getReplicateData返回了这些技术的列表复制。
If multiple reagents are used to target the same gene, different reagent pairs that target the same gene pair are extracted from the screen. These pairs are returned by getIndDesignData.
如果有多个试剂被用来针对相同的基因,从屏幕上的目标是相同的基因对不同试剂对提取。这些成对返回getIndDesignData的。
用法----------Usage----------
getReplicateData(sgi, screen, channel,
type = "data", design = "template",
do.trafo = TRUE, do.inv.trafo = FALSE,
normalized = FALSE)
getIndDesignData(sgi, screen, channel,
type = "data", design = "template",
do.trafo = TRUE, do.inv.trafo = FALSE,
normalized = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:sgi
An object of class RNAinteract.
对象类RNAinteract。
参数:screen
The screen name from which the replicates will be extracted.
将提取的复制从屏幕名称。
参数:channel
The channel name from which the replicates will be extracted.
通道的名称从其中的复制将被提取。
参数:type
The type of data that is extracted. It is the type argument of the getData function.
中提取的数据类型。这是getData函数的类型参数。
参数:design, do.trafo, do.inv.trafo, normalized
See the getData documentation for details.
有关详细信息,请参阅getData文件。
值----------Value----------
Returns a data.frame with columns x and y.
返回一个x和y列的数据框。
作者(S)----------Author(s)----------
Bernd Fischer
参见----------See Also----------
RNAinteract-package
RNAinteract-package
举例----------Examples----------
data("sgi")
res <- getIndDesignData(sgi, screen="1", channel="nrCells", type = "data")
plot(res$x, res$y)
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