R语言 RNAinteract包 getMain()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getMain(RNAinteract)
getMain()所属R语言包：RNAinteract

                                         get main effects
                                         获得主效应

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns the main effects.
返回主效应。


用法----------Usage----------


getMain(sgi, type = "main", design = "template", summary = "none",
        QueryNr = NULL, TemplatePlate = NULL,
        do.inv.trafo = FALSE, format = "plain", withoutgroups = c(),
        screen = NULL, channel = NULL, normalized = TRUE, drop = TRUE)
getMainNeg(sgi, type = "all", do.inv.trafo = FALSE,
        screen = NULL, channel = NULL, drop = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：sgi
An object of class RNAinteract
一个对象的类RNAinteract


参数：type
always "main"
始终以“主”


参数：design
Either "template" or "query" defining if template or query main effects are returned.
无论是“模板”或“查询”定义模板或查询主要影响返回。


参数：summary
If summary is "targets" the main effects are summarized per target gene.
如果总结是“目标”的主要影响概述每靶基因。


参数：QueryNr,TemplatePlate
Onle main effects of one query nr or one template plate are returned.  
一个查询NR或一个模板板onle主效应被返回。


参数：format
targetmatrix
targetmatrix


参数：withoutgroups
The genes within this group are not shown in the heatmap. It is convenient to hide screen controls.
在这一组中的基因不会显示在热图。这是方便隐藏屏幕控制。


参数：do.inv.trafo
If TRUE, the data will be back-transformed for original scale of data. In the case of log-transformed data, the main effects are returned as factors, otherwise the main effects are returned as log values.
如果为TRUE，将数据转化为原始数据规模。在数转换的数据的情况下，主要影响因素返回，否则返回log值的主要影响。


参数：screen
The screen from which the main effects should be returned.
从主要作用，应返回的屏幕。


参数：channel
The channel from which the main effects should be returned.
从主要作用，应返回的通道。


参数：drop
Does return a drop array dimensions, even if only one screen or one channel is selected.
并返回一个下拉阵列尺寸，即使只有一个画面或一个通道被选中。


参数：normalized
If true the normalized main effects are returned.
如果为true返回标准化的主要影响。


值----------Value----------

An array containing the main effects.
一个数组，包含的主要影响。


作者（S）----------Author(s)----------



Bernd Fischer




参见----------See Also----------

RNAinteract-package
RNAinteract-package


举例----------Examples----------


data("sgi")
getMain(sgi)
getMainNeg(sgi)

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