R语言 RNAinteract包 estimateMainEffect()函数中文帮助文档(中英文对照)

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estimateMainEffect(RNAinteract)
estimateMainEffect()所属R语言包：RNAinteract

                                         estimate main effect
                                         估计主要作用

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

estimates the main effects in an additive model.
加法模型中估计的主效应。


用法----------Usage----------


estimateMainEffect(sgi, use.query = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：sgi
An object of class RNAinteract.  
对象类RNAinteract。


参数：use.query
A list of reagent identifiers as annotated in the RID field of the reagent list. For the estimation of the template main effects only these queries are used.  
注明试剂在RID试剂列表字段标识符的列表。为模板的主效应估计只有这些查询使用。


Details

详情----------Details----------

The main effect is the single RNAi knockdown effect. When use.query is not specified, the main effect is estimated by minimizing the L1 distance from the non-interacting model to the double RNAi measurements. The implemented non-interacting model is the additive model (sum of single main effects). If the screen does not contain a lot of query genes with no or ery small main effect, it is recommended to estimate the template main effects only by using selected query genes. This can be obtained by specifying use.query. To estimate main effects in a multiplicative model define Transformation="log2" when creating the RNAinteract object (See createRNAinteractFromFiles), which is already the default.
主要作用是单一的RNAi击倒效果。未指定use.query时，主要作用是通过减少从非相互作用的模型，双RNA干扰测量的L1距离估计。实施非相互作用的模型是加法模型（单主效应的总和）。如果屏幕上没有包含很多查询的基因没有或红霉素小的主要作用，它建议估计只能通过选择查询基因模板的主要作用。这可以得到指定use.query。估计乘法模型中的主要作用定义Transformation="log2"时创建的RNAinteract对象（见createRNAinteractFromFiles），这已经是默认。


值----------Value----------

An object of class RNAinteract.
对象类RNAinteract。


作者（S）----------Author(s)----------



Bernd Fischer




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

RNAinteract-package
RNAinteract-package


举例----------Examples----------


data("sgi")
sgi <- estimateMainEffect(sgi)
getMain(sgi)

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注：
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