R语言 rMAT包 tilingSet()函数中文帮助文档(中英文对照)

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tilingSet(rMAT)
tilingSet()所属R语言包：rMAT

                                        This object contains an ExpressionSet
                                         此对象包含1 ExpressionSet的

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This object contains an ExpressionSet and has the following additional slots:  genomeName, featureSequence, featurePosition, featureChromosome, featureCopyNumber
此对象包含有以下的附加插槽：genomeName，featureSequence，featurePosition，featureChromosome，featureCopyNumber一个ExpressionSet和


Details

详情----------Details----------

Tiling set objects can also be combined using the rbind methods. This is particularly useful when several arrays span a genome/chromosome.
平铺一套对象也可以结合使用rbind方法。这是特别有用的，当几个阵列跨越基因/染色体。


作者（S）----------Author(s)----------



Charles Cheung, <a href="mailto:cykc@interchange.ubc.ca">cykc@interchange.ubc.ca</a> and
Raphael Gottardo, <a href="mailto:rgottard@fhcrc.org">rgottard@fhcrc.org</a>
Arnaud Droit, <a href="mailto:arnaud.droit@crchuq.ulaval.ca">arnaud.droit@crchuq.ulaval.ca</a>




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

BPMAPCelParser, NormalizeProbes
BPMAPCelParser，NormalizeProbes


举例----------Examples----------



featureChromosome=factor(c("chr1","chr1","chr1","chr1"))
featurePosition=c(as.integer(47193),as.integer(47197),as.integer(47201),
    as.integer(47205))
featureCopyNumber=c(as.integer(1),as.integer(1),as.integer(1),as.integer(1))
a=5.379897
exprs=matrix(a,nrow=4)
genomeName="Sc03b_MR_v04_10000"
featureSequence=c("TCATCAAGGGAAGAGAGTCTCTCAG","TGATCATCACGGGACTTCTGGTTTA","CGGGACTTCTGGTTTATGGAACTAT","ACTTCTGGTTTATGGAACTATAAGG")

newSet <- new('tilingSet', featureChromosome=featureChromosome,
    featurePosition=featurePosition,featureCopyNumber=featureCopyNumber,
    exprs=exprs, genomeName=genomeName, featureSequence=featureSequence)


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