R语言 Ringo包 extractProbeAnno()函数中文帮助文档(中英文对照)

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extractProbeAnno(Ringo)
extractProbeAnno()所属R语言包：Ringo

                                        Build probeAnno from match positions in an RGList
                                         建立在RGList比赛的位置probeAnno的

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function can be used to build a probeAnno object from the reporter match positions given in the  'genes' slot of an RGList if present, as is the case with some ChIP-chip microarray platforms, e.g. with certain Agilent ones after reading in the data with read.maimages(...,"agilent").
此功能可用于建造1 probeAnno对象，记者从比赛中的基因的RGList插槽位置，如果存在，是一些芯片芯片芯片平台的情况下，如与某些安捷伦的后阅读read.maimages(...,"agilent")的数据。


用法----------Usage----------


extractProbeAnno(object, format = "agilent", ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an object that holds the data and the probe match positions, currently can only be of class RGList
一个对象，它拥有的数据和探针匹配的位置，目前只能是类RGList


参数：format
in which format are the reporter match positions stored in the object; see details; currently only "agilent" is implemented
格式在记者匹配对象中存储的位置，看到的细节，目前仅实施“安捷伦”


参数：...
further arguments that are passed on to the function posToProbeAnno
进一步的参数传递到函数posToProbeAnno


Details

详情----------Details----------

Which information is used for creating the probeAnno is specified by the argument format.
哪些信息是创建的probeAnno的使用指定的参数format。

expects that the object is of class RGList. The 'genes' element of the object is taken. This element is expected to have at least a column 'ProbeName', which stores the unique reporter/probe identifiers, and a column 'SystematicName', which holds the probe match position in the format "chr<chromosome>:coordinate1-coordinate2", e.g."chr1:087354051-087354110".
预计，对象是类的RGList。 基因的对象元素。此元素，预计将有至少一列“ProbeName”，其中存储的独特记者/探针标识，一列“SystematicName，持有格式”<chromosome> CHR：coordinate1 coordinate2的探针匹配的位置“ ，如“chr1 :087354051-087354110”。


值----------Value----------

An object of  class probeAnno holding the mapping between reporters and genomic positions.
一个类的对象probeAnno举行的记者和基因组的位置之间的映射。


作者（S）----------Author(s)----------


Joern Toedling



参见----------See Also----------

posToProbeAnno, probeAnno-class
posToProbeAnno，probeAnno-class

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注：
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