R语言 rHVDM包 HVDMcheck()函数中文帮助文档(中英文对照)

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HVDMcheck(rHVDM)
HVDMcheck()所属R语言包：rHVDM

                                        Checks that an object of class ExpressionSet is compliant with HVDM
                                         检查，类ExpressionSet的对象是符合与HVDM

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This method issues warnings about the compliance of the ExpressionSet object to be used with rHVDM. It just issues warnings and does not attempt to correct the problems encountered. the pdata argument is optional; if missing, the method will check the phenodata that is inside the ExpressionSet.
这种方法的问题有关遵守要与rHVDM使用的ExpressionSet对象的警告。它只是发出警告，并没有试图纠正所遇到的问题。 pdata参数是可选的，如果丢失，该方法将检查内的ExpressionSet的phenodata。


用法----------Usage----------


HVDMcheck(eset,pdata)



参数----------Arguments----------

参数：eset
an ExpressionSet object (Biobase)  
ExpressionSet对象（BIOBASE）


参数：pdata
a dataframe (optional argument)  
1 dataframe（可选参数）


Details

详情----------Details----------

The checks performed are: A) the phenoData has all the required fields. B) the time field is numeric, has a zero time point, does not have negative or repeated values. C) the row names in the phenoData  are consistent with the columns names found in the ExpressionSet. D) the data are not log-transformed. E) Standard deviations have been supplied in the ExpressionSet, and they are non-negative.
执行的检查是：一）在phenoData拥有所有必需的字段。二）时间字段是数字，有一个零的时间点，没有消极或重复值。 c）在phenoData行名称在ExpressionSet发现列名一致。 D）的数据都无法登录转化。五）提供的标准偏差在ExpressionSet，他们都是非负。


值----------Value----------

no value returned.  
没有返回值。


注意----------Note----------

If the pdata argument is ignored (it can be),
如果pdata参数将被忽略（它可以是），


作者（S）----------Author(s)----------


Martino Barenco



参考文献----------References----------

of p53 targets using Hidden Variable Dynamic Modelling. Genome Biology, V7(3), R25.

参见----------See Also----------

training
training


举例----------Examples----------


data(HVDMexample)
HVDMcheck(fiveGyMAS5)

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