R语言 Repitools包 multiHeatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

multiHeatmap(Repitools)
multiHeatmap()所属R语言包：Repitools

                                        Superfigure plots
                                         superfigure图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a list of matrices and plots heatmaps for each one.  There are several features for the spacing (X and Y), colour scales, titles and label sizes.  If a matrix has row and/or column names, these are added to the plot.
这个函数接受一个矩阵图热图的每一个列表。间距（X和Y），色标，标题和标签尺寸有几个特点。如果一个矩阵的行和/或列名，这些被添加到图。


用法----------Usage----------


multiHeatmap(dataList, colourList, titles = NULL, main = "", showColour = TRUE, xspace = 1, cwidth = 0.5, ystarts = c(0.05, 0.9, 0.925, 0.95, 0.98), rlabelcex = 1, clabelcex = 1, titlecex = 1.2, maincex = 1.5, scalecex = 0.7, offset=.001)



参数----------Arguments----------

参数：dataList
A list of matrices to be plotted as different panels
一个list矩阵将绘制成不同的面板


参数：colourList
A list of colourscales (if length 1, it is copied for all panels of the plot)
一个listcolourscales的（如果长度为1，它是复制图板）


参数：titles
A vector of panel titles
一个面板职称的向量


参数：main
A main title
一个主要的称号


参数：showColour
logical or logical vector, whether to plot the colour scale
逻辑或逻辑的向量，是否绘制色阶


参数：xspace
The space between the panels (relative to number of columns).  This can be either a scalar or a vector of length(dataList)+1  
面板之间的空间（相对列数）。这可以是一个标量或向量的length(dataList)+1


参数：cwidth
widths of the colour scales relative to the width of the panels
色阶面板的宽度相对宽度


参数：ystarts
A vector of length 5 of numbers between 0 and 1 giving the relative Y positions of where the heatmaps, colourscale labels, colour scales, panel titles and main title (respectively) start
一个长度为5的数字0和1之间的热图，colourscale标签，色标，面板标题，主标题（分别）开始的相对Y位置向量


参数：rlabelcex
character expansion factor for row labels
字符行标签的膨胀系数


参数：clabelcex
character expansion factor for column labels
字符列标签的膨胀系数


参数：titlecex
character expansion factor for panel titles
字符面板职称的膨胀系数的


参数：maincex
character expansion factor for main title
主标题字符膨胀系数


参数：scalecex
character expansion factor for colour scale labels
字符颜色刻度标签的膨胀系数


参数：offset
small offset to adjust scales for point beyond the colour scale boundaries
小胶印机来调整颜色的规模边界以外的点尺度


值----------Value----------

This function is called for its output, a plot in the current device.
此功能称为它的输出，在当前设备的图。


作者（S）----------Author(s)----------


Mark Robinson



举例----------Examples----------


library(gplots)

cL <- NULL
br <- seq(-3,3,length=101)
col <- colorpanel(low="blue",mid="grey",high="red",n=100)
cL[[1]] <- list(breaks=br,colors=col)
br <- seq(-2,2,length=101)
col <- colorpanel(low="green",mid="black",high="red",n=100)
cL[[2]] <- list(breaks=br,colors=col)
br <- seq(0,20,length=101)
col <- colorpanel(low="black",mid="grey",high="white",n=100)
cL[[3]] <- list(breaks=br,colors=col)

testD <- list(matrix(runif(400),nrow=20),matrix(rnorm(100),nrow=20),matrix(rpois(100,lambda=10),nrow=20))
colnames(testD[[1]]) <- letters[1:20]
rownames(testD[[1]]) <- paste("row",1:20,sep="")

multiHeatmap(testD,cL,xspace=1)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。