mergeReplicates(Repitools)
mergeReplicates()所属R语言包:Repitools
Merge GRanges that are of replicate experiments.
合并重复实验的农庄。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A lane of next generation sequencing data can be stored as a GRanges object. Sometimes, a GRangesList of various lanes can have experimental replicates. This function allows the merging of such elements.
一个车道的下一代测序数据可以存储为一个GRanges对象。有时候,一个GRangesList的各种车道可以有实验重复。此功能允许这些元素的合并。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'GRangesList'
mergeReplicates(reads, types, verbose = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:reads
A GRangesList.
AGRangesList。
参数:types
A vector the same length as reads, that gives what type of experiment each element is of.
一个向量的长度相同,reads,让每个元素是什么类型的实验。
参数:verbose
Whether to print the progess of processing.
无论是打印处理陆侃。
Details
详情----------Details----------
The experiment type that each element of the merged list is of, is
合并列表中的每个元素,实验类型
值----------Value----------
A GRangesList with one element per experiment type.
一个GRangesList实验类型的每一个元素。
作者(S)----------Author(s)----------
Dario Strbenac
举例----------Examples----------
library(GenomicRanges)
grl <- GRangesList(GRanges("chr1", IRanges(5, 10)),
GRanges("chr18", IRanges(25, 50)),
GRanges("chr22", IRanges(1, 100)))
antibody <- c("MeDIP", "MeDIP", "H3K4me3")
mergeReplicates(grl, antibody)
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注:
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