R语言 Repitools包 annoGR2DF()函数中文帮助文档(中英文对照)

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annoGR2DF(Repitools)
annoGR2DF()所属R语言包：Repitools

                                        Convert an annotated GRanges to a data.frame.
                                         数据框转换为注释农庄。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Converting a GRanges that might be annotated with some kind of results to a data.frame is useful, because it allows easier writing to file and viewing in other programs, like a spreadsheet program.
转换这可能是一些样的结果注释GRangesdata.frame是有用的，因为它允许更容易书写，如电子表格程序，其他程序文件，并在观看。


用法----------Usage----------


  ## S4 method for signature 'GRanges'
annoGR2DF(anno)



参数----------Arguments----------

参数：anno
A GRanges, describing some genomic features.
一个GRanges，说明一些基因的功能。


Details

详情----------Details----------

The column name seqnames is changed to chr, and if all the strands are *, then the strand column is dropped.
列名seqnames改为chr，如果所有的股*，然后strand列被丢弃。


值----------Value----------

A data.frame of the annotation.
一个data.frame注解。


作者（S）----------Author(s)----------


Dario Strbenac



举例----------Examples----------


  require(GenomicRanges)
  chrs <- c("chr1", "chr3", "chr7", "chr22")
  starts <- seq(1000, 4000, 1000)
  ends <- seq(1500, 4500, 1000)
  t <- c(3.11, 0.93, 2.28, -0.18)
  gc <- c("High", "High", "Low", "High")
  gr <- GRanges(chrs, IRanges(starts, ends), strand = '*', t, gc)

  annoGR2DF(gr)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。