R语言 REDseq包 summarizeBySeq()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

summarizeBySeq(REDseq)
summarizeBySeq()所属R语言包：REDseq

                                         Output count/weight summary by sequences
                                         通过序列的输出数量/重量摘要

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Output count/weight summary by sequences with each row representing each sequences
每一行代表每个序列的序列输出数量/重量总结


用法----------Usage----------


summarizeBySeq(assignedSeqs, by =c("Weight", "SEQid"))



参数----------Arguments----------

参数：assignedSeqs
output from assignSeq2REsite          
从assignSeq2REsite输出


参数：by
Weight if sum up the weight for each sequence, SEQid if sum the occurrence of each sequence  
重量，如果每个序列的重量总和，SEQid每个序列的发生，如果总和


值----------Value----------

a matrix with SEQid as the first column and total count/weight as the second column
作为第一列和第二列的总数/重量矩阵与SEQid


作者（S）----------Author(s)----------



Lihua Julie Zhu




参见----------See Also----------

summarizeByRE, assignSeq2REsite
summarizeByRE，assignSeq2REsite


举例----------Examples----------


        data(example.assignedREDseq)
        summarizeBySeq(example.assignedREDseq, by="Weight")
        summarizeBySeq(example.assignedREDseq,by="SEQid")

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