R语言 RedeR包 nesthc()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

nesthc(RedeR)
nesthc()所属R语言包：RedeR

                                        Nest hclust objects to containers.
                                         到容器的鸟巢hclust对象。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Method to nest nodes in an active RedeR session.  
活跃瑞德会议的巢节点的方法。


用法----------Usage----------


nesthc(obj, hc, ...)



参数----------Arguments----------

参数：obj
Object of RedPort Class.  
对象的RedPort类。


参数：hc
Either an object of hclust of pvclust class.
无论对象pvclust类hclust。


参数：...
Additional arguments passed to RedeR application; if a "pvclust" object, it also passes arguments for "pvpick" function (e.g. to set the p-value threshold).   
额外的参数传递给瑞德应用;如果的“pvclust”对象，它也传递功能的“pvpick”（如p值阈值设置）的论点。


Details

详情----------Details----------

Additional arguments:
额外的参数：




cutlevel Numeric value indicating the point where the hclust object should be cut (default = 2). The distance is related to the option 'metric'. For "rootdist" and "leafdist", the cut level is related to the n steps required to get to the root's level or to the leaf's level, respectively (n>=1). For 'height', the cut is related to the corresponding dendrogram height <numeric>.
cutlevel表示，其中hclust对象应削减（默认为2）点的数值。距离有关选项“度量”。为的“rootdist”和“leafdist”，削减水平相关的n所需的步骤去根的水平，或叶的水平，分别为（N> = 1）。为“高度”，截止到相应的树状高度<numeric>。




metric Metric used to cut the hclust object at the top level (Options: "rootdist", "leafdist" or "height"; default="rootdist") <string>.
公吨削减hclust对象在顶层（选项“rootdist”，“leafdist”或“高度”;默认=“rootdist）公制<string>的。




nmemb Minimum number of members for a nest (>=2) <numeric>.
nmemb最小的成员人数为巢（> = 2）<numeric>。




nlev Maximum number of levels of a nested sequence (default=2) <numeric>.
nlev一个嵌套序列水平的最大数量（默认值= 2）<numeric>。




grid Number of rows and cols to lay out graphs in the panel (default = c(2,3)) <numeric>.
网格的行数和cols奠定了面板中的图形（默认= C（2,3））<numeric>。




gridScale Expansion factor of the grid area in the app panel. Options: 0.0 to 100 (default = 75) <numeric>.
在应用程序面板的网格区域gridScale膨胀系数。选项：0.0~100（默认值= 75）<numeric>。




gscale Expansion factor to set the nest area related to the parents &ndash; or related to the app panel. Provided as a vector with three numbers, c(n1,n2,n3):  n1 is related to nests at the first level of the hierarchy (i.e. nests rooted to the panel); n2 is related to nests from single branches, and n3 nests from double branches (default = c(30,75,45)) <numeric>.
gscale膨胀系数，设置相关的父母 - 或相关的应用程序面板的巢区。提供三个数字作为向量，C（N1，N2，N3）：N1是在层次结构的第一级（即巢扎根面板）的巢; N2是从单枝筑巢，N3巢从双枝（默认值= C（30,75,45））<numeric>。




isAnchor Logical value; it sets whether to anchor containers in dynamic layouts.
isAnchor逻辑值;设置是否停泊在动态布局的容器。




isAssign Logical value; it sets whether to assign container names to nested nodes.
isAssign逻辑值，它设置是否指定容器名称嵌套节点。




theme Some pre-defined nest attributes. Options: 'tm0','tm1','tm2','tm3','tm4','tm5', 'tm6' (default: 'tm6') <string>. Alternatively, it can be a list with customized attributes.
一些预定义的主题巢属性。选项：：TM0，TM1，TM2，“TM3，”TM4，“TM5，TM6（默认：”TM6）<string>的。另外，它可以是一个定制的属性列表。




nlinewidth Line width of a nested series containers.
nlinewidth线的一系列嵌套容器的宽度。




nfontsz Label font size a nested series containers.
nfontsz标签的字体大小嵌套的系列容器。




plothc Logical value; whether to plot the corresponding hclust object (i.e. dendrogram).
plothc逻辑值;是否绘制相应hclust对象（即聚类）。




col A color vector; it is used to color labels in both containers and corresponding hclust object (i.e. dendrogram nodes).
COL颜色向量，它是用来在两个容器和的相应hclust对象（即树状节点）的彩色标签。




cex Numeric character expansion factor of dendrogram text and labels.
树状文本和标签的的CEX数字字符的膨胀系数。




xlab A label for the dendrogram x axis.
XLab中树状X轴的标签。




ylab A label for the dendrogram y axis.
ylab树状Y轴的标签。


值----------Value----------

Add/change graph objects and plot corresponding hclust object.
添加/更改图形对象和图相应hclust对象。


注意----------Note----------

Prior calling this method invoke RedeR application via XML-RPC server (i.e. 'calld').
之前调用此方法调用瑞德应用通过XML-RPC服务器（即“calld）。


作者（S）----------Author(s)----------


Mauro Castro



参见----------See Also----------

RedPort nestNodes gtoy.rm
RedPortnestNodesgtoy.rm


举例----------Examples----------



g <- gtoy.rm()
hc<-hclust(dist(get.adjacency(g)))
#plot(hc)[图（HC）]

rdp <- RedPort('MyPort')

## Not run: [＃无法运行：]

  calld(rdp)
  addGraph(rdp,g)
  nesthc(rdp, hc)


## End(Not run)  [＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。