R语言 ReadqPCR包 read.taqman()函数中文帮助文档(中英文对照)

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read.taqman(ReadqPCR)
read.taqman()所属R语言包：ReadqPCR

                                         Read Taqman qPCR data and produce a qPCRBatch
                                         阅读的TaqMan qPCR数据，并产生一个qPCRBatch

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reads Taqman RT-qPCR data and uses the data to populate an object of class "qPCRBatch".
荧光定量RT-qPCR数据读取和使用数据填充一个对象类"qPCRBatch"。


用法----------Usage----------


read.taqman(...,
           filenames = character(0),
           phenoData = new("AnnotatedDataFrame"),
           notes = "",
           verbose = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：...
file names separated by comma.
用逗号分隔的文件名。


参数：filenames
file names in a character vector.
文件名称中的字符向量。


参数：phenoData
an AnnotatedDataFrame object, a character of length one, or a data.frame.
AnnotatedDataFrame对象，长度，或characterdata.frame。


参数：notes
notes.
笔记。


参数：verbose
verbosity flag. If true more messages are given to the user on the processing steps
冗长的标志。如果真正的更多的消息提供给用户的处理步骤


Details

详情----------Details----------

Permits the user to read in qPCR Ct value data from an sds output file,  alongside phenotypic data and further notes about the data. If phenoData  is a data.frame, it is converted to an AnnotatedDataFrame. If it is NULL then a default object  of class AnnotatedDataFrame is created, whose pData is a data.frame with rownames being the names of the , and with one column sample with an integer index. More details on how technical replicates are handled in the ReadqPCR package vignette
允许用户读取旁边的表型数据和有关数据进一步指出，在qPCR的CT值数据从SDS输出文件。如果phenoData是1 data.frame，它被转换为一个AnnotatedDataFrame。如果是的话NULL然后AnnotatedDataFrame类的默认对象创建，其pData是的名称rownames data.frame，与一列<X >一个整数索引。技术复制出更多的细节处理sample包小插曲


值----------Value----------

Object of class "qPCRBatch".
对象类"qPCRBatch"。


作者（S）----------Author(s)----------


James Perkins <a href="mailto:jperkins@biochem.ucl.ac.uk">jperkins@biochem.ucl.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

ExpressionSet-class
ExpressionSet-class


举例----------Examples----------


  path <- system.file("exData", package = "ReadqPCR")
  # read 1 file[读1个文件]
  taqman.example <- file.path(path, "example.txt")
  qPCRBatch.taq <- read.taqman(taqman.example)
  # read 2 files[读2个文件]
  taqman.example.second.file <- file.path(path, "example2.txt")
  qPCRBatch.taq.two.files <- read.taqman(taqman.example,
                             taqman.example.second.file)

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