plotDR(RDRToolbox)
plotDR()所属R语言包：RDRToolbox
Plotting tool for two and three dimensional data
绘图工具的二维和三维数据
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Creates two and three dimensional plots of (labeled) data. It uses the library "rgl" for rotatable 3D scatterplots.
创建二，三（标记）数据的三维图。它使用库为可旋转的3D散点图“RGL”。
用法----------Usage----------
plotDR(data, labels, axesLabels=c("x","y","z"), legend=FALSE, text, col, pch, ...)
参数----------Arguments----------
参数：data
matrix with values to be plotted (rows correspond to samples, columns to features)
要绘制的值矩阵（行对应的样本，列功能）
参数：labels
vector containing labels of the classes within the data (optional)
向量标签内的数据的类（可选）
参数：axesLabels
vector containing labels for the axes of the plot
图轴向量标签
参数：legend
logical value whether to automatically insert a legend into the plot
逻辑值是否自动插入到一个传奇的图
参数：text
vector with (short) labels for each point (optional)
向量与每个点（短）标签（可选）
参数：col
character vector of colours for each class (optional); see colors() to display a list of available colours
矢量字符颜色为每个类（可选）;colors()显示可用的颜色列表
参数：pch
character or integer value specifying the symbol when plotting points (see ?par or ?points for more info)
打印时指定符号的字符或整型值点（详情参见?par或?points）
参数：...
other common R plot parameters like for example las, cex or font to further customize the plot (see ?par for possible arguments); some parameters may only work with two dimensional plots
其他常见的R图的参数，如las，cex或font来进一步自定义图（见?par可能的参数）例如一些参数可能只使用二维图
Details
详情----------Details----------
It colours the data points according to given class labels (max. six classes when using default colours). A legend will be printed in the R console by default (for three dimensional plots, a legend is not supported).
它的颜色的数据点，根据给定类的标签（最多六班时使用默认颜色）。传说将被打印在默认情况下，的ř控制台（三维图，传说是不支持）。
作者（S）----------Author(s)----------
Christoph Bartenhagen
举例----------Examples----------
## plot a two dimensional LLE embedding of a 1.000 dimensional dataset[＃绘制二维的LLE嵌入了1.000的三维数据集]
d = generateData(samples=20, genes=1000, diffgenes=100, blocksize=10)
d_low = LLE(data=d[[1]], dim=2, k=5)
plotDR(data=d_low, labels=d[[2]])
## plot a three dimensional LLE embedding of a 1.000 dimensional dataset[＃绘制立体的LLE嵌入了1.000的三维数据集]
d = generateData(samples=20, genes=1000, diffgenes=100, blocksize=10)
d_low = LLE(data=d[[1]], dim=3, k=5)
plotDR(data=d_low, labels=d[[2]])
## plot a two dimensional LLE embedding of a 1.000 dimensional dataset[＃绘制二维的LLE嵌入了1.000的三维数据集]
## add axis labels, a legend and plot a text for each sample[＃添加轴标签，一个传奇，每个样品绘制文本]
d = generateData(samples=20, genes=1000, diffgenes=100, blocksize=10)
d_low = LLE(data=d[[1]], dim=2, k=5)
text = letters[1:20]
plotDR(data=d_low, labels=d[[2]], axesLabels=c("first component", "second component"), text=text, legend=TRUE)
## manually add a legend to the plot[＃手动添加一个传奇的图]
plotDR(data=d_low, labels=d[[2]], axesLabels=c("first component", "second component"), text=text)
legend("topright", legend=c("class 1","class 2"), col=c("black", "red"), pch=1)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-26 12:29:26
