R语言 rbsurv包 rbsurv.default()函数中文帮助文档(中英文对照)

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rbsurv.default(rbsurv)
rbsurv.default()所属R语言包：rbsurv

                                        Robust likelihood-based survival modeling
                                         健壮的可能性为基础的生存建模

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This selects survival-associated genes with microarray data.
这将选择与生存相关的基因芯片数据。


用法----------Usage----------


    ## Default S3 method:
rbsurv(time, status, x, z=NULL, alpha=1, gene.ID=NULL, method="efron",
                   n.iter=10, n.fold=3,  n.seq=1,  seed=1234, max.n.genes=nrow(x),...)



参数----------Arguments----------

参数：time
a vector for survival times
存活时间的向量


参数：status
a vector for survival status, 0=censored, 1=event
生存状态向量，0 =审查，1 =事件


参数：x
a matrix for expression values (genes in rows, samples in columns)
为表达值矩阵（基因行，列中的样本）


参数：z
a matrix for risk factors
风险因素的矩阵


参数：alpha
significance level for evaluating  risk factors; significant risk factors included with the alpha level  if alpha < 1
评估风险因素的重要的危险因素包括α水平显着性水平α<1


参数：gene.ID
a vector for gene IDs; if NULL, row numbers are assigned.
一个基因标识的向量;如果为NULL，行号分配。


参数：method
a character string specifying the method for tie handling.  Choose one of "efron", "breslow", "exact". The default is "efron".  If there are no tied death times all the methods are equivalent.  
一个字符串，指定领带处理方法。选择“埃弗龙”，“布瑞斯罗夫”，“精确”。默认是“埃弗龙”。如果有没有绑的死亡时间，所有的方法都是相同的。


参数：n.iter
the number of iterations for gene selection
基因选择迭代次数


参数：n.fold
the number of partitions of samples
样本的分区数


参数：n.seq
the number of sequential runs or multiple models
连续运行或多个型号的数量


参数：seed
a seed for sample partitioning
种子样品分区


参数：max.n.genes
the maximum number of genes considered. If the number of the input genes is greater than the given number, it is reduced by fitting individual Cox models.
最大的基因数量。如果输入的基因数量是大于给定的数字，它减少了个人拟合Cox模型。


参数：...
other arguments
其他参数


值----------Value----------


参数：model
survival-associated gene model
生存相关的基因模型


参数：n.genes
number of genes
基因数目


参数：n.samples
number of samples
样本数


参数：method
method for tie handling
领带处理方法


参数：covariates
covariates
协变量


参数：n.iter
number of iterations for gene seletion
迭代次数为基因seletion


参数：n.fold
number of partitions of samples
数样品分区


参数：n.seq
number of sequential runs or multiple models
数连续运行或多个模型


参数：gene.list
a list of genes included in the models
模型中包含的基因列表


作者（S）----------Author(s)----------



HyungJun Cho, Sukwoo Kim, Soo-heang Eo, and Jaewoo Kang




参考文献----------References----------

Robust likelihood-based survival modeling for microarray gene expression Data, Journal of Statistical Software, 29(1):1-16. URL http://www.jstatsoft.org/v29/i01/.

参见----------See Also----------

rbsurv
rbsurv

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注：
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