R语言 RankProd包 arab()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

arab(RankProd)
arab()所属R语言包：RankProd

                                        Genomic Response to Brassinosteroid in Arabidopsis
                                         拟南芥油菜基因组响应

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data if from Affy ATH1 array experiments of  genomic response to brassinosteroid in Arabidopsis  conducted at two laoratories. The data set contains  random selected 500 genes and 10 samples, 6 from lab 1 and 4 from  lab 2. Data was pre-processed by RMA
这个数据，如果从Affy ATH1阵列基因在两个laoratories进行拟南芥油菜实验。该数据集包含了随机选取的500个基因和10个样品从实验室，从实验室1 6和4。数据预先处理RMA


用法----------Usage----------


data(arab)



值----------Value----------


参数：arab
matrix of gene expression levels of 500 genes  from 10 samples, rows correspond to genes  and  columns to mRNA samples.
来自10个样品500个基因的基因表达水平的矩阵，行对应的mRNA样品的基因和列。


参数：arab.cl
numeric vector indicating the treatment class,  5 brassinosteroid-treated cases (code 1)  and 5 control cases (code 0)  
数字矢量显示，治疗类，油菜素内酯处理的情况（代码1）和5例（代码0）


参数：arab.gnames
character vector containing the AffyID of  the 500 genes for the expression matrix arab
特征向量包含的500个基因的表达矩阵arab AffyID


参数：arab.origin
numeric vector indicating the origin of  the samples, 6 samples from lab 1 (code 1)  and 4 samples from lab 2 (code 2)  
数字矢量显示样品的起源，从实验室1（代码1）和6个样品，从实验室样品2（代码2）


参考文献----------References----------

brassinosteroid and auxin signaling in Arabidopsis.  PLoS Biol. 2004 21460.
(http://arabidopsis.org/info/expression/ATGenExpress.jsp)
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