R语言 RamiGO包 adjM2gml()函数中文帮助文档(中英文对照)

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adjM2gml(RamiGO)
adjM2gml()所属R语言包：RamiGO

                                         Create GML file from readAmigoDot output.
                                         GML文件创建从readAmigoDot输出。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Takes a part of the output of the readAmigoDot function and creates a GML file by calling exportCytoGML().
注意到输出的readAmigoDot功能的一部分，由调用exportCytoGML（）创建的GML文件。


用法----------Usage----------


adjM2gml(adjMatrix, edgecolor, vertexcolor,
  nodelabels, nodedescription, filename)



参数----------Arguments----------

参数：adjMatrix
adjacency matrix, parents in rows, children in cols.  
邻接矩阵，行的家长，在COLS儿童。


参数：edgecolor
character vector of the length of existing edges.  
现有边长的特征向量。


参数：vertexcolor
character vector of the length of existing nodes.  
特征向量的现有节点的长度。


参数：nodelabels
character vector of the length of existing nodes.  
特征向量的现有节点的长度。


参数：nodedescription
character vector of the length of existing nodes.  
特征向量的现有节点的长度。


参数：filename
output filenames.  
输出文件名。


作者（S）----------Author(s)----------



Markus Schroeder <mschroed@jimmy.harvard.edu>

Benjamin Haibe-Kains <bhaibeka@jimmy.harvard.edu>




举例----------Examples----------


## set GO ID's and color[＃设置好编号和颜色]
goIDs <- c("GO:0051130","GO:0019912","GO:0005783")
color <- c("lightblue","red","yellow")

dd <- getAmigoTree(goIDs=goIDs,color=color,
  filename="example",picType="dot",saveResult=FALSE)
tt <- readAmigoDot(object=dd)

adjM2gml(adjMatrix(tt),relations(tt)$color,
  annot(tt)$fillcolor,annot(tt)$GO_ID,
  annot(tt)$description,"example")

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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