assayDataAmp(R453Plus1Toolbox)
assayDataAmp()所属R语言包:R453Plus1Toolbox
Access the amplicon data of an AVASet.
一个AVASet访问扩增数据。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Similar to assayData of the Biobase ExpressionSet, this function returns the assay data of the amplicon slot of an instance of the AVASet.
类似assayDataBIOBASE ExpressionSet,这个函数返回一个实例的AVASet扩增槽的检测数据。
用法----------Usage----------
assayDataAmp(object)
参数----------Arguments----------
参数:object
An link{AVASet-class} object.
link{AVASet-class}对象。
值----------Value----------
The assay data of the amplicon slot consists of a list of two data frames with the number of forward and reverse reads of all amplicons for each sample (see AVASet-class for details).
扩增槽的检测数据,包括两个数据框向前和反向读取每个样品扩增(见AVASet-class细节)。
作者(S)----------Author(s)----------
Christoph Bartenhagen
参见----------See Also----------
fDataAmp, featureDataAmp, AVASet-class
fDataAmp,featureDataAmp,AVASet-class
举例----------Examples----------
# load an AVA dataset containing 6 samples, 4 amplicons and 259 variants[加载AVA的数据集,其中包含6个样品,4扩增和259变种]
data(avaSetExample)
# show contents of amplicon assay data[扩增检测数据显示的内容]
assayDataAmp(avaSetExample)
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