R语言 r3Cseq包 plotOverviewInteractions()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotOverviewInteractions(r3Cseq)
plotOverviewInteractions()所属R语言包：r3Cseq

                                        Plot the overview of interaction regions for the genome-wide
                                         互动的区域为全基因组的绘制概述

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot the distribution of interaction regions across genome with the level of interaction signal
绘制整个基因组的相互作用区域分布交互信号的水平


用法----------Usage----------


plotOverviewInteractions(object, cutoff.p_value=0.05,cutoff.fold_change=2)



参数----------Arguments----------

参数：object
r3Cseq object. The object is the container of interaction regions produced by getInteractions function.  
r3Cseq对象。对象是getInteractions功能所产生的相互作用区的容器。


参数：cutoff.p_value
Numeric. The cutoff p-value from empirical distribution function (default=0.05)  
数字。截止p值从经验分布函数（默认值= 0.05）


参数：cutoff.fold_change
Numeric. The cutoff fold change compare between experiment and control (default=2)  
数字。截止倍之间比较实验和控制（默认为2）


值----------Value----------

Plots interaction regions genome-wide on the active graphical device.
图的相互作用区域的全基因组上活跃的图形设备。


作者（S）----------Author(s)----------



S. Thongjuea




参见----------See Also----------

plotInteractionsNearViewpoint, plotInteractionsPerChromosome,  plot3Cecdf
plotInteractionsNearViewpoint，plotInteractionsPerChromosome，plot3Cecdf


举例----------Examples----------


       
####Create the r3Cseq object#############[＃＃＃创建r3Cseq对象＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
        library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
    load(system.file("data","example.data.rda",package="r3Cseq"))
        calculateRPM(my.data)
        getInteractions(my.data)

####Plot[＃＃＃图]
       
        plotOverviewInteractions(my.data)
       

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。