R语言 r3Cseq包 getReadCountPerRestrictionFragment()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getReadCountPerRestrictionFragment(r3Cseq)
getReadCountPerRestrictionFragment()所属R语言包：r3Cseq

                                        get read count per restriction fragment for 3C-seq data
                                         获得阅读每限制性片段3C-seq的数据计数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Counts the number of reads from 3C-seq data per each restriction fragment
数从每人每个限制性片段3C-seq的数据读取


用法----------Usage----------


getReadCountPerRestrictionFragment(object)



参数----------Arguments----------

参数：object
r3Cseq object, The initialize input parameters are required  
r3Cseq对象，初始化输入参数是必需的


值----------Value----------

The RangedData represents the number of reads per each restriction fragment
该RangedData表示，每读取每个限制性片段


作者（S）----------Author(s)----------



S. Thongjuea




参见----------See Also----------

getCoverage,
getCoverage，


举例----------Examples----------


       
####Create the r3Cseq object#############[＃＃＃创建r3Cseq对象＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
        library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
    expFile<-system.file("extdata","alignedReads.fetal.liver.subset.bam",package="r3Cseq")
    contrFile<-system.file("extdata","alignedReads.fetal.brain.subset.bam",package="r3Cseq")
       
        my.data<-new("r3Cseq",organismName='mm9',alignedReadsBamExpFile=expFile,
        alignedReadsBamContrFile=contrFile,isControlInvolved=TRUE,isBamInputFile=TRUE,
        expLabel="fetal_liver",contrLabel="fetal_brain",
        restrictionEnzyme='HindIII')
       
        getReadCountPerRestrictionFragment(my.data)
       

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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