R语言 r3Cseq包 export3Cseq2bedGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

export3Cseq2bedGraph(r3Cseq)
export3Cseq2bedGraph()所属R语言包：r3Cseq

                                        export interaction regions to the 'bedGraph' format
                                         “bedGraph”格式导出相互作用区域

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

export interaction regions from RagedData to the bedGraph format, which suitable for uploading to the UCSC genome browser
出口互动区从RagedData到的bedGraph格式，适合上传到UCSC基因组浏览器


用法----------Usage----------


export3Cseq2bedGraph(object,datatype=c("rpm","raw_read"))



参数----------Arguments----------

参数：object
r3Cseq object, The object might contain the interaction regions generated by function getInteractions  
r3Cseq对象，该对象可能包含互动功能getInteractions产生的区域


参数：datatype
raw_read : read count per restriction fragment rpm : read per million per restriction fragment  
raw_read：读取计数每限制片段转速：每限制性片段阅读每百万


值----------Value----------

The text file in 'bedGraph' format
在bedGraph“格式的文本文件


作者（S）----------Author(s)----------



S. Thongjuea




参见----------See Also----------

getInteractions
getInteractions


举例----------Examples----------


       
####Create the r3Cseq object#############[＃＃＃创建r3Cseq对象＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
        library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
    load(system.file("data","example.data.rda",package="r3Cseq"))
        calculateRPM(my.data)
        getInteractions(my.data)
        export3Cseq2bedGraph(my.data,datatype="rpm")       

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。