expInteractionRegions(r3Cseq)
expInteractionRegions()所属R语言包:r3Cseq
get interaction regions from the experiment
从实验中得到互动区域
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
get all candidate interaction regions from the experiment
从实验中得到所有候选人的互动区
用法----------Usage----------
expInteractionRegions(object)
参数----------Arguments----------
参数:object
r3Cseq object. The object might contain the interaction regions generated by function getInteractions
r3Cseq对象。对象的可能包含互动功能getInteractions产生的区域
值----------Value----------
The candidate interaction regions show in the IRange object
候选人互动区域显示在IRange对象
作者(S)----------Author(s)----------
S. Thongjuea
参见----------See Also----------
getCoverage, getReadCountPerRestrictionFragment, calculateRPM, getInteractions, contrInteractionRegions
getCoverage,getReadCountPerRestrictionFragment,calculateRPM,getInteractions,contrInteractionRegions
举例----------Examples----------
####Create the r3Cseq object#############[###创建r3Cseq对象#############]
library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
load(system.file("data","example.data.rda",package="r3Cseq"))
calculateRPM(my.data)
getInteractions(my.data)
exp.interactions<-expInteractionRegions(my.data)
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