paintCytobands(quantsmooth)
paintCytobands()所属R语言包:quantsmooth
Paint a chromosomal idiogram
画一个染色体idiogram
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Paints a human chromosomal idiogram in an existing plot Adapted from the paint.chromosome function in the lodplot package by David L Duffy
描绘了人类在现有的图改编由大号达菲大卫从在lodplot包paint.chromosome功能的染色体idiogram
用法----------Usage----------
paintCytobands(chrom, pos = c(0, 0), units = c("cM", "bases", "ISCN"), width = 0.4,
length.out, bands = "major", orientation = c("h","v"), legend = TRUE,
cex.leg = 0.7, bleach = 0, ...)
参数----------Arguments----------
参数:chrom
chromosomal id, chromosome to plot 1:22,X,Y
染色体ID,X,Y染色体积1点22分
参数:pos
numeric vector of length 2, position in the plot to start the plot
数字矢量长度为2,在小区的位置开始的图
参数:units
units along which to plot the chromosome
单位一起绘制染色体
参数:width
numeric, width of the chromosome, the chromosome is plotted between pos[2] and pos[2]-width
数字,宽度染色体,染色体之间绘制pos[2]和pos[2]-width
参数:length.out
numeric, if given, the chromosome will have this length in the plot
数字,如果有,染色体将在图长度
参数:bands
if not equal to "major", then also the minor bands will be plotted
如果不等于“大”,然后还未成年人的乐队将绘制
参数:orientation
chromosome is plotted either Horizontally to the right of the starting point or Vertically down from the starting point
染色体起点右侧绘制水平或垂直向下从起点
参数:legend
logical, if TRUE then the bandnames are plotted next to the chromosome
逻辑,如果TRUE然后bandnames绘制染色体
参数:cex.leg
numeric, relative size of legend text
图例文本的数字,相对大小
参数:bleach
numeric [0,1], proportion by which to bleach the chromosome
数字[0,1],比例漂白染色体
参数:...
extra parameters for plot
额外的参数plot
值----------Value----------
This function is executed for its side effects
这个函数执行它的副作用
作者(S)----------Author(s)----------
David L Duffy , Jan Oosting
参考文献----------References----------
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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