grid.chromosome(quantsmooth)
grid.chromosome()所属R语言包:quantsmooth
Draw a chromosome using the grid package
使用网格包绘制染色体
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A chromosme is drawn including the cytobands
是包括在cytobands绘制一个chromosme
用法----------Usage----------
grid.chromosome(chrom, side = 1, units = c("cM", "bases", "ISCN"), chrom.width = 0.5, length.out,
bands = "major", legend = c("chrom", "band", "none"), cex.leg = 0.7, bleach = 0, ...)
参数----------Arguments----------
参数:chrom
numeric or character, id of chromosome to plot
数字或字符,ID号染色体绘图
参数:side
numeric [1:4], side of rectangle to draw, 4 sides, side 2 and 4 are vertical
数字[1:4],边画矩形,两侧,一侧2和4是垂直
参数:units
character, type of unit to use
单位使用性质,类型
参数:chrom.width
numeric [0,1], The width relative to the width (sides 2 and 4) or height(sides 1 and 3) of the viewport
数字[0,1],相对宽度(双方2和4)的宽度或高度(双方1和3)视口
参数:length.out
numeric, size of native units of viewport
数字,本地单位视口的大小
参数:bands
character, draw either major or minor bands
字符,画以或大或小的乐队
参数:legend
character, type of legend
性格,类型的传说
参数:cex.leg
numeric, relative size of legend text
图例文本的数字,相对大小
参数:bleach
numeric [0,1], proportion by which to bleach the chromosome
数字[0,1],比例漂白染色体
参数:...
arguments for viewport(), especially x,y, width, and height
视口()的参数,尤其是X,Y,宽度和高度
Details
详情----------Details----------
The chromosome is drawn within a rectangle defined by x, y, width, and height, which is pushed as a viewport. The legend is drawn within the same rectangle in the space left over by chrom.width.
染色体是X,Y,宽度和高度,这是作为一个视推定义的矩形内绘制。传说是由chrom.width遗留下来的空间,在相同的矩形内绘制。
值----------Value----------
This function is executed for its side effects
这个函数执行它的副作用
作者(S)----------Author(s)----------
David L Duffy ,Jan Oosting
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
grid.newpage()
grid.chromosome(1,units="bases",height=0.15)
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