R语言 qrqc包 SequenceSummary-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SequenceSummary-class(qrqc)
SequenceSummary-class()所属R语言包：qrqc

                                        SequenceSummary class representing the summaries of a sequence file
                                         SequenceSummary类代表一个序列文件的摘要

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A sequence file read in with readSeqFile is summarized by a C call. This is a base class with slots common to both FASTQSummary and  FASTASummary. This is not usually instantiated directly.
总结由一个C调用序列文件中读用readSeqFile。这是一个既FASTQSummary和FASTASummary槽共同的基类。这通常不是直接实例化。


插槽----------Slots----------




filename the filename processed by readSeqFile.
filenamereadSeqFile处理的文件名。“




base.freqs a dataframe of base frequencies by position. Each column is a nucleotide (there is a column for position too), and each row contains the count frequencies of bases for that
base.freqsdataframe的基础频率的位置。每一列是一个核苷酸（有一列位置太），每一行包含了该碱基的计数频率




seq.lengths a numeric vector of the number of sequences of a
seq.lengths的一个序列号码的数字向量




hash a numeric vector of the count frequencies of
hash的计数频率的数字向量




hashed a logical indicating whether the sequences were
hashed逻辑序列是否


作者（S）----------Author(s)----------


Vince Buffalo <vsbuffalo@ucdavis.edu>



参见----------See Also----------

FASTQSummary and FASTASummary are the classes that inherit from SequenceSummary.
FASTQSummary和FASTASummary从SequenceSummary继承的类。

readSeqFile is the function that takes a FASTQ or FASTA file and returns a FASTQSummary object or FASTASummary object.
readSeqFile是需要FASTQ或FASTA文件，并返回FASTQSummary对象或FASTASummary对象的功能。


举例----------Examples----------


showClass("SequenceSummary")

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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